近日，第二屆全國自動化建庫大賽圓滿落幕，由我院何牮、孟梅、周獻超組成的上海交通大學醫(yī)學院單細胞中心賽隊，榮獲二等獎。本次大賽吸引了超50家單位100+位專業(yè)選手報名參賽，群英薈萃，高手云集。我院參賽隊一路披荊斬棘，最終脫穎而出！
關于大賽
第二屆全國自動化建庫大賽由上海市遺傳學會和華大智造共同發(fā)起，面向全國科研院校、醫(yī)院、第三方獨立醫(yī)檢所、政府公衛(wèi)系統(tǒng)等實驗室專業(yè)人員。大賽歷時3個月，歷經(jīng)理論培訓及考核、實操培訓及考核、生信分析等一系列賽事階段，注重對參賽選手實際操作和應用的考查。
我院單細胞中心賽隊獲獎后表示：“這次大賽為我們與業(yè)界優(yōu)秀單位提供了交流和展示實力的平臺。在比賽中，我們感受到了華大智造作為國產(chǎn)儀器代表的擔當和飛躍。本次獲獎是對所有來自科研院校選手的鼓勵，也是對我們能力在高通量測序業(yè)界的認可。”
建庫&測序
隨著高通量測序技術日趨成熟和成本降低，其已被廣泛應用于遺傳優(yōu)生、腫瘤診療等科研和臨床中。近年來，單細胞高通量測序不斷發(fā)展，被應用于單個細胞（核）的全基因組、全外顯子組、全長轉(zhuǎn)錄組、甲基化組分析及高通量單細胞（核）的轉(zhuǎn)錄組測序乃至空間轉(zhuǎn)錄組等多種應用場景中。
單細胞文庫的構(gòu)建是上述測序方案開展的前提，自動化建庫可以簡化工作流程，減少人工誤差，構(gòu)建更快、更穩(wěn)定、更高質(zhì)量的文庫。
平臺引入&展望
為了能更加高效、靈活、經(jīng)濟地開展基于高通量測序技術的研究，單細胞組學中心在2021年引入華大智造高通量測序全流程平臺，包括高通量測序系統(tǒng)MGISEQ-2000、自動化樣本制備自動系統(tǒng)MGISP-100以及配套單細胞組學方案。
相信通過引入得心應手的國產(chǎn)化實驗工具和平臺，我們的單細胞測序效能會大大提升，助力我們更好地開發(fā)和優(yōu)化單細胞分析技術。為我們中心、學校，以及外部研究人員提供前沿的單細胞研究，為研究人類重大疾病的機制、開發(fā)新的生物標志物和治療靶點提供理論基礎和設施。
未來我們有信心在單細胞多組學研究這條道路上一往無前，繼續(xù)堅持一貫追求最高質(zhì)量的工作態(tài)度，秉承腳踏實地的工作作風，在新的一年更上一層樓！
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年度最佳｜這！就是建庫！第二屆全國自動化建庫大賽圓滿落幕！
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