癌癥是全球主要的公共衛(wèi)生問題,，且成為我國第三大,、美國第二大死亡原因。《臨床腫瘤雜志》“CA”期刊發(fā)布的2021年癌癥統(tǒng)計報告顯示,，無論是在男性還是女性中,，結(jié)直腸癌的發(fā)病率和死亡率都位居第三,，極大地加重了社會負擔(dān),，因此亟需新的結(jié)直腸癌早篩方法和治療方案用于臨床。最近大量研究表明,，結(jié)直腸癌的發(fā)生發(fā)展與腸道微生物組的改變密切相關(guān),，而腸道微生物組包括細菌、真菌,、古菌和病毒四界微生物組,，因此，對于結(jié)直腸癌發(fā)生發(fā)展的機制圍繞腸道微生物組四個界別的微生物開展整體的,、客觀的和系統(tǒng)的研究,，尚屬空白。
近日,，上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院公共衛(wèi)生學(xué)院王慧教授聯(lián)合同濟大學(xué)朱瑞新教授,、中科院上海營養(yǎng)與健康研究所張國慶教授、復(fù)旦大學(xué)陳興棟教授和中山大學(xué)附屬第六醫(yī)院朱立新教授團隊,，國際知名期刊《自然微生物》雜志（Nature Microbiology）發(fā)表了題為Multi-kingdom microbiota analyses identify bacterial–fungal interactions and biomarkers of colorectal cancer across cohorts的研究論文,，該研究針對結(jié)直腸癌患者腸道菌群的四界微生物組進行多中心隊列研究，分析和繪制了全球八個結(jié)直腸癌人群隊列的四界微生物組圖譜,，發(fā)現(xiàn)結(jié)直腸癌特異的細菌-真菌互作新機制,，為結(jié)直腸癌診斷提供了基于微生物及其功能標志物的新方法。
該研究整合了全球8個國家/地區(qū)的結(jié)直腸癌隊列共1368例標本的宏基因組數(shù)據(jù),，不僅發(fā)現(xiàn)了可用于結(jié)直腸癌診斷的單界別微生物菌株標志物（27個細菌,、20個真菌、20個古菌和21個病毒物種）,，還首次發(fā)現(xiàn)了準確性更高的多界別最小核心菌群（11個細菌,、4個真菌和1個古菌）,，此外,，通過宏基因組功能預(yù)測，結(jié)直腸癌患者腸道菌群的D-氨基酸代謝和丁酸鹽代謝水平顯著升高,?？傊撗芯坎粌H揭示了不同地域人群中普遍存在的結(jié)直腸癌特異的微生物標志物,，同時驗證了四界微生物組作為結(jié)直腸癌診斷輔助工具的可行性,，并進一步提出了微生物及其相關(guān)功能基因作為治療結(jié)直腸癌潛在靶點的可能性，為結(jié)直腸癌早期診斷和預(yù)后評估提供了基于微生物及其功能標志物的新方法和新思路,。
圖1.多中心隊列中共有的結(jié)直腸癌特異性真菌標志物及其診斷能力預(yù)測
該研究得到了國家科技部重點研發(fā)計劃,、國家自然科學(xué)基金,、上海市科委和衛(wèi)健委等項目的資助，第一作者和最后通訊作者單位為上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院,。上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院公共衛(wèi)生學(xué)院劉寧寧研究員,、浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬兒童醫(yī)院焦娜研究員、上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院公共衛(wèi)生學(xué)院碩士研究生譚鏡璁,、上海市中醫(yī)醫(yī)院王子良研究員為論文的共同第一作者,。該項目還得到了合作方中國科學(xué)院趙國屏院士、海軍軍醫(yī)大學(xué)廖萬清院士,、海軍軍醫(yī)大學(xué)潘煒華教授,、海軍軍醫(yī)大學(xué)方文捷博士、美國農(nóng)業(yè)部農(nóng)業(yè)研究局Geromy G. Moore教授,、上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院單細胞組學(xué)與疾病研究中心Christopher Heeschen教授,、世界衛(wèi)生組織國際癌癥研究署Zisis Kozlakidis教授的大力支持和幫助。
感謝論文三位審稿人 Ran Blekhman, Aleksandar Kostic和George Miller,，對該項工作給予了高度評價：“All my concerns have been addressed. I believe that this is an important contribution.” “I would like to congratulate the authors on this interesting and comprehensive study. My concerns have been sufficiently addressed.”
