9月21日，國際頂尖腫瘤學(xué)期刊Cancer Cell（《癌細(xì)胞》IF=50.3）在線發(fā)表了公共衛(wèi)生學(xué)院/單細(xì)胞組學(xué)與疾病研究中心/腫瘤系統(tǒng)醫(yī)學(xué)全國重點實驗室王慧/劉寧寧聯(lián)合團(tuán)隊題為“The intratumor mycobiome promotes lung cancer progression via myeloid-derived suppressor cells”的研究論文，該研究首次闡明真菌促進(jìn)肺癌發(fā)展的分子機(jī)制,，引發(fā)業(yè)界廣泛關(guān)注。聯(lián)合團(tuán)隊從腫瘤組織內(nèi)分離并鑒定出一株促進(jìn)肺癌發(fā)展的真菌菌株—聚多曲霉,，通過整合深度宏基因組學(xué),、培養(yǎng)組學(xué),、基因組學(xué),、轉(zhuǎn)錄組學(xué)等多組學(xué)技術(shù),，解析了肺腺癌患者不同組織部位內(nèi)的真菌微生物組的種類與分布特征，闡明瘤內(nèi)真菌聚多曲霉通過與宿主之間的相互作用,，誘導(dǎo)腫瘤免疫抑制的微環(huán)境,，最終促進(jìn)肺癌發(fā)展的機(jī)制，同時證實聚多曲霉在腫瘤內(nèi)的富集與肺癌患者的較差預(yù)后密切相關(guān)，該研究具有重大的公共衛(wèi)生,、疾病篩查和肺癌精準(zhǔn)治療意義,。在公眾健康領(lǐng)域，該發(fā)現(xiàn)為肺癌的早篩提供了新型真菌標(biāo)志物,；在疾病治療領(lǐng)域,，在菌株水平精準(zhǔn)靶向真菌可以促進(jìn)免疫殺傷，從而抑制肺癌的惡化進(jìn)展,，該項研究成果將極大推動基于靶向真菌的肺癌個體化靶向-免疫治療新策略,，填補(bǔ)真菌和肺癌分子機(jī)制研究方面的空白,。
近年來,，“多形態(tài)微生物組”被列為癌癥的新標(biāo)志物，促進(jìn)了人類對癌癥認(rèn)知的重大突破,。腫瘤內(nèi)微生物組是腫瘤微環(huán)境的重要組成部分,，其與宿主的相互作用對癌癥的發(fā)生、發(fā)展至關(guān)重要,，因此腫瘤內(nèi)微生物研究為癌癥的診斷,、篩查和治療提供了嶄新的視角。然而,，人們對瘤內(nèi)微生物組的異質(zhì)性,、潛在來源和富集，以及癌癥惡化等關(guān)鍵問題了解甚微,。探討腫瘤內(nèi)四界微生物組在癌癥的發(fā)病和藥物治療過程中的分子生物學(xué)機(jī)制和健康價值,，將為制定中國人群癌癥的精準(zhǔn)篩查與防治策略提供重要的理論基礎(chǔ)。
前期,，該聯(lián)合團(tuán)隊在本領(lǐng)域已經(jīng)積累了豐富的研究基礎(chǔ)和系列成果：①自主研發(fā)了單細(xì)胞微生物組,、單細(xì)胞蛋白質(zhì)組和瘤內(nèi)四界菌群時空轉(zhuǎn)錄組分析等核心技術(shù)，突破了傳統(tǒng)微生物組與宿主交互作用研究的技術(shù)瓶頸,，整合營養(yǎng)流行病學(xué),、宏基因組、蛋白質(zhì)組,、代謝組,、單細(xì)胞組學(xué)、人群元數(shù)據(jù)和臨床數(shù)據(jù)等多維度多模態(tài)數(shù)據(jù)信息,，構(gòu)建出膳食營養(yǎng)-瘤內(nèi)四界微生物組（細(xì)菌,、真菌、古菌,、病毒）-代謝物-蛋白質(zhì)-免疫狀態(tài)-健康效應(yīng)之間的關(guān)聯(lián)和時空演化規(guī)律圖譜,；②建立了樣本采集、保存和運(yùn)輸、微生物組DNA富集和提取,、測序和分析,、培養(yǎng)組學(xué)分離活菌、分子,、細(xì)胞和動物實驗驗證等一整套真菌微生物組研究的標(biāo)準(zhǔn)操作規(guī)程（SOP）,，目前已經(jīng)在科技部國家重點研發(fā)計劃項目的資助下，在全國多家醫(yī)院投入使用（Nat Protoc 2017; Nat Commun 2021; Npj Precis Oncol 2020; Phenomics 2023; Front Cell Infect Microbiol (Editorial) 2023）,，同時正在與世界衛(wèi)生組織（WHO）合作推動該SOP的國際化認(rèn)證,；在真菌與宿主相互作用分子機(jī)制研究方面，取得了系列重要研究成果（Cell Res 2010; PLoS Genet 2013; PNAS 2017; PLoS Pathog 2018; mBio 2020; Microbiol Spectr 2022; Cell Rep 2022）,；③依托單細(xì)胞組學(xué)與疾病研究中心,，前期研制多項單細(xì)胞前沿研究技術(shù)和瘤內(nèi)四界菌群分析研究方法（Gut 2017; EBioMedicine 2017; Cell Discovery 2017; Sci Total Environ 2020; Adv Mater 2020; Clin Transl Med 2021; Nat Commun 2021; Nature 2021, MedComm 2022; J Pharm Anal 2023），建成規(guī)模最大,、覆蓋最廣,、數(shù)據(jù)最全的基于宏基因組測序的結(jié)直腸癌患者腸道四界微生物組及互作網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫（Nat Microb, 2022 ESI高被引論文）。以上成果均為本項目的順利開展奠定了良好的研究基礎(chǔ),。
圖1：聚多曲霉（Aspergillus sydowii）通過細(xì)胞壁中的β-glucan結(jié)合Dectin-1,，誘導(dǎo)宿主細(xì)胞CARD9信號通路的表達(dá)，促進(jìn)IL-1β的分泌募集下游MDSCs細(xì)胞,，增強(qiáng)其抑制CD8+ T細(xì)胞殺傷的能力,，最終誘導(dǎo)免疫抑制微環(huán)境的形成，從而促進(jìn)肺癌發(fā)展,。
本研究以公共衛(wèi)生學(xué)院為第一作者和通訊作者單位,，同濟(jì)大學(xué)附屬上海市肺科醫(yī)院與中科院上海免疫與感染研究所為共同第一作者和共同通訊作者單位。劉寧寧研究員為第一作者兼共同通訊作者,，同濟(jì)大學(xué)醫(yī)學(xué)院易呈祥博士以及公共衛(wèi)生學(xué)院衛(wèi)璐琦博士為共同第一作者,，通訊作者為王慧教授、劉寧寧研究員,、張鵬教授和陳昌斌研究員,。該研究得到了上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院單細(xì)胞組學(xué)與疾病研究中心Christopher Heeschen教授和鄭小琪教授、上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第一人民醫(yī)院鐘林教授,、中國科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心季紅斌教授和楊巍維教授,、南昌大學(xué)第一附屬醫(yī)院黃孝天和曾令兵教授、世界衛(wèi)生組織國際癌癥研究署主任Zisis Kozlakidis教授,、清華大學(xué)林欣教授,、南京師范大學(xué)陸玲教授、上海市免疫學(xué)研究所劉智多研究員,、上海市腫瘤研究所覃文新教授的大力支持和幫助,，同時得到了科技部國家重點研發(fā)計劃,、國家自然科學(xué)基金委、上海市科委,、上海市教委,、上海高水平地方高校創(chuàng)新團(tuán)隊等項目資助。
公共衛(wèi)生學(xué)院是上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院的重要組成部分,。公共衛(wèi)生學(xué)院的建設(shè)緊扣“健康中國”,、“數(shù)字中國”重大需求，堅持立德樹人,，培養(yǎng)有靈魂復(fù)合型卓越公共衛(wèi)生創(chuàng)新人才,，通過發(fā)揮新醫(yī)科和理工文科相結(jié)合的整體優(yōu)勢，打造了“一體多翼,、多學(xué)科協(xié)同”的發(fā)展模式,。構(gòu)建了“醫(yī)防融合、醫(yī)工醫(yī)理醫(yī)文交叉,、宏觀+微觀,、人群+基礎(chǔ)”的“大公衛(wèi)”特色學(xué)科群,，在US NEWS,、ARWU、TIMES等國際和國內(nèi)學(xué)科排名中位列國內(nèi)高校前列,，形成“全日制本科,、學(xué)術(shù)學(xué)位碩士、專業(yè)學(xué)位碩士,、博士和博士后”的多層次辦學(xué)格局以及圍繞“問題導(dǎo)向-科研訓(xùn)練-學(xué)科融合-實踐教學(xué)-綜合評價”的人才培養(yǎng)模式,。此外，牽頭上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院單細(xì)胞組學(xué)與疾病研究中心和上海交通大學(xué)數(shù)字醫(yī)學(xué)研究院建設(shè),，探索集基礎(chǔ),、人群、臨床,、預(yù)防,、政策研究等多學(xué)科融合創(chuàng)新模式，匯聚了一批國際頂級科學(xué)家,。學(xué)院重點聚焦公共衛(wèi)生安全與應(yīng)急管理,、數(shù)字化全生命周期健康研究、公共健康政策與管理,、全球健康與全健康四大公共衛(wèi)生重大研究領(lǐng)域,，并打造了若干多學(xué)科交叉科研共享平臺，包括國家全民數(shù)字素養(yǎng)與技能培訓(xùn)基地,、上海市病媒生物預(yù)防控制實訓(xùn)基地,、上海市營養(yǎng)創(chuàng)新平臺數(shù)字營養(yǎng)中心,、上海市轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)協(xié)同創(chuàng)新中心-食品安全與毒理學(xué)評價中心、上海市學(xué)生（青少年）科創(chuàng)教育基地,、上海交通大學(xué)數(shù)字醫(yī)學(xué)研究院數(shù)字公衛(wèi)中心,、上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)科普教育融媒體分中心、與瑞金醫(yī)院共建公共衛(wèi)生應(yīng)急醫(yī)學(xué)培訓(xùn)基地等,。學(xué)院下設(shè)流行病學(xué)與生物統(tǒng)計學(xué)系,、營養(yǎng)與食品安全系、環(huán)境與健康系,、婦女兒童健康系,、社區(qū)健康與行為醫(yī)學(xué)系和社會醫(yī)學(xué)與衛(wèi)生事業(yè)管理系，設(shè)有生命早期健康研究中心,、主動健康與循證決策研究中心,、智慧健康研究中心、醫(yī)學(xué)科普與健康傳播研究中心,、衛(wèi)生技術(shù)評估研究所等學(xué)科交叉研究平臺,，擁有公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué)一級學(xué)科博士學(xué)位和碩士學(xué)位授權(quán)點、公共衛(wèi)生專業(yè)碩士（MPH）學(xué)位授權(quán)點,，入選國家級一流本科專業(yè)建設(shè)點,，獲批上海市公共衛(wèi)生專業(yè)博士學(xué)位培育點。從全球視野把握公衛(wèi)前沿領(lǐng)域發(fā)展,，以構(gòu)建人類健康共同體為己任,，打造國際領(lǐng)先、國內(nèi)一流,、 最具時代特征和創(chuàng)新活力的高水平公共衛(wèi)生學(xué)院,，培養(yǎng)具有扎實基礎(chǔ)+多學(xué)科交叉思維+科研創(chuàng)新強(qiáng)+國際化視野廣+公共衛(wèi)生領(lǐng)導(dǎo)力的復(fù)合型人才，為國家公共衛(wèi)生事業(yè)發(fā)展貢獻(xiàn)力量,。
原文鏈接：
https://www.cell.com/cancer-cell/fulltext/S1535-6108(23)00288-X
