個人簡介
劉寧寧 研究員/博士生導(dǎo)師
博士畢業(yè)于中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院,；在哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院從事博士后研究，之后進入上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院公共衛(wèi)生學(xué)院工作,，任研究員/博士生導(dǎo)師,，同時擔任上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院單細胞組學(xué)與疾病研究中心主任助理,。主要聚焦真菌感染與癌癥發(fā)展分子機制研究,，從真菌-宿主相互作用角度揭示真菌感染及調(diào)控癌癥發(fā)生發(fā)展的分子機制,，為防治真菌感染及癌癥提供新靶標和新策略,。在Nature Microbiology, Nature Protocols, Cell Research, PNAS, Nature Communications等雜志以第一/通訊(含共同)作者發(fā)表論文27篇,，授權(quán)發(fā)明專利4項,，主持國家重點研發(fā)計劃課題、國自然面上和青年等項目,。
學(xué)術(shù)任職
美國醫(yī)學(xué)真菌學(xué)會會員,、中華預(yù)防醫(yī)學(xué)會衛(wèi)生毒理分會青年委員、上海市預(yù)防醫(yī)學(xué)會衛(wèi)生檢驗專委會副主任委員,、上海市免疫學(xué)會感染免疫專委會秘書和委員及多個期刊編委,。
獎勵榮譽
上海市優(yōu)秀學(xué)術(shù)帶頭人（青年）
社會任職
上海市青聯(lián)第十二屆委員會委員
研究領(lǐng)域：真菌感染與癌癥發(fā)展
真菌微生物組是人體微生物組的重要組成部分，所占比例不到1%,，但真菌群落在人體健康與疾病狀態(tài)中扮演著關(guān)鍵角色,。近年來隨著高通量測序技術(shù)的廣泛應(yīng)用，人體不同部位如口腔,、肺部,、消化道、陰道以及皮膚真菌組的結(jié)構(gòu)和組成被解析,，其在人體健康和疾病中的重要功能也逐漸被揭示,。同時，人體真菌微生物組對細菌微生物組乃至病毒組的組成也有影響,，是維持微生物組結(jié)構(gòu)和代謝功能穩(wěn)定的關(guān)鍵物種,，真菌組對宿主的免疫應(yīng)答作用也對某些疾病的發(fā)生發(fā)展有顯著影響。
最新研究表明,，真菌普遍存在于人類腫瘤中,，這一發(fā)現(xiàn)應(yīng)促使我們更好地探索其潛在影響，并通過‘微生物組視角’重新審視我們對癌癥的幾乎所有認知,。因此,，我們的科學(xué)問題就是：真菌如何進入腫瘤？如何在腫瘤內(nèi)生存,、定植并和腫瘤組織共存,？真菌和細菌如何相互作用維持腫瘤微環(huán)境？回答該問題可能帶來重大的變革,，不僅是癌癥檢測方面,，也包括在與藥物開發(fā)、癌癥演變,、微小殘留病灶,、復(fù)發(fā)和輔助診斷有關(guān)的其他生物技術(shù)應(yīng)用方面,。
代表性論文
(1) Liu NN, Jiao N, Tan JC, Wang Z, Wu D, Wang AJ, Chen J, Tao L, Zhou C, Fang W, Cheong IH, Pan W, Liao W, Kozlakidis Z, Heeschen C, Moore GG, Zhu L, Chen X, Zhang G, Zhu R, Wang H. Multi-kingdom microbiota analyses identify bacterial-fungal interactions and biomarkers of colorectal cancer across cohorts. Nat Microbiol. 2022 Feb;7(2):238-250. doi: 10.1038/s41564-021-01030-7. Epub 2022 Jan 27. PMID: 35087227; PMCID: PMC8813618.
(2) Wang Y, Zhou J, Zou Y, Chen X, Liu L, Qi W, Huang X, Chen C, Liu NN. Fungal commensalism modulated by a dual-action phosphate transceptor. Cell Rep. 2022 Jan 25;38(4):110293. doi: 10.1016/j.celrep.2021.110293. PMID: 35081357.
(3) Wu Y, Jiao N, Zhu R, Zhang Y, Wu D, Wang AJ, Fang S, Tao L, Li Y, Cheng S, He X, Lan P, Tian C, Liu NN, Zhu L. Identification of microbial markers across populations in early detection of colorectal cancer. Nat Commun. 2021 May 24;12(1):3063. doi: 10.1038/s41467-021-23265-y. PMID: 34031391; PMCID: PMC8144394. (Co-corresponding author)
(4) Yi S, Liu NN, Hu L, Wang H, Sahni N. Base-resolution stratification of cancer mutations using functional variomics. Nat Protoc. 2017 Nov;12(11):2323-2341. doi: 10.1038/nprot.2017.086. Epub 2017 Oct 5. PMID: 28981122; PMCID: PMC6145840. (# Co-first author)
(5) Liu NN, Ma Q, Ge Y, Yi CX, Wei LQ, Tan JC, Chu Q, Li JQ, Zhang P, Wang H. Microbiome dysbiosis in lung cancer: from composition to therapy. NPJ Precis Oncol. 2020 Dec 10;4(1):33. doi: 10.1038/s41698-020-00138-z. PMID: 33303906; PMCID: PMC7730185.
(6) Liu NN, Acosta-Zaldívar M, Qi W, Diray-Arce J, Walker LA, Kottom TJ, Kelly R, Yuan M, Asara JM, Lasky-Su JA, Levy O, Limper AH, Gow NAR, Köhler JR. Phosphoric Metabolites Link Phosphate Import and Polysaccharide Biosynthesis for Candida albicans Cell Wall Maintenance. mBio. 2020 Mar 17;11(2):e03225-19. doi: 10.1128/mBio.03225-19. PMID: 32184254; PMCID: PMC7078483.
(7) Liu NN, Uppuluri P, Broggi A, Besold A, Ryman K, Kambara H, Solis N, Lorenz V, Qi W, Acosta-Zaldívar M, Emami SN, Bao B, An D, Bonilla FA, Sola-Visner M, Filler SG, Luo HR, Engström Y, Ljungdahl PO, Culotta VC, Zanoni I, Lopez-Ribot JL, Köhler JR. Intersection of phosphate transport, oxidative stress and TOR signalling in Candida albicans virulence. PLoS Pathog. 2018 Jul 30;14(7):e1007076. doi: 10.1371/journal.ppat.1007076. PMID: 30059535; PMCID: PMC6085062.
