上海市兒童醫(yī)院是一所集醫(yī)療,、保健,、教學(xué)、科研、康復(fù)于一體的三級(jí)甲等兒童醫(yī)院,，前身是由我國(guó)著名兒科專(zhuān)家富文壽及現(xiàn)代兒童營(yíng)養(yǎng)學(xué)創(chuàng)始人蘇祖斐等前輩于1937年創(chuàng)辦的上海難童醫(yī)院，1953年更名為上海市兒童醫(yī)院,，是我國(guó)第一家兒童專(zhuān)科醫(yī)院,。2003年成為上海交通大學(xué)附屬兒童醫(yī)院。
醫(yī)院現(xiàn)有員工1600余人,，2019年度門(mén)診量265.81萬(wàn)人次,，年住院病人5.27萬(wàn)人次，住院手術(shù)量3.9萬(wàn)人次,。2014年3月投入運(yùn)營(yíng)的瀘定路院區(qū)位于普陀區(qū)長(zhǎng)風(fēng)生態(tài)商務(wù)區(qū),，院區(qū)占地面積約2.6公頃，核定床位550張,。北京西路院區(qū)占地面積1.59公頃,，建筑面積約2.5萬(wàn)平方米，核定床位150張,。2013年4月28日梅川路門(mén)診部啟用運(yùn)營(yíng),，2014年3月始為兒童康復(fù)中心，為患兒提供包括聽(tīng)力,、視力,、智力、肢體,、精神等發(fā)育障礙的康復(fù)訓(xùn)練和治療,。
醫(yī)院學(xué)科齊全，設(shè)有重癥醫(yī)學(xué)科,、新生兒科,、腎臟科、呼吸科,、血液科,、消化科、心臟內(nèi)科,、神經(jīng)內(nèi)科,、內(nèi)分泌科、普外科,、心胸外科,、神經(jīng)外科、骨科、泌尿外科,、耳鼻咽喉頭頸外科,、兒童保健科、皮膚科,、眼科,、中醫(yī)科、口腔科,、康復(fù)科,、醫(yī)學(xué)遺傳科等23個(gè)臨床專(zhuān)科。醫(yī)院擁有中國(guó)工程院院士1名,、博士生導(dǎo)師16名,、碩士生導(dǎo)師42名，擁有高級(jí)職稱(chēng)專(zhuān)家百余名,。是上海醫(yī)學(xué)遺傳研究所,、上海市兒童保健所、上海市兒童急救中心,、上海市新生兒篩查中心,、上海市兒童康復(fù)中心、上海市聽(tīng)力障礙診治中心,、上海市新生兒先心篩查診治中心所在地,。我院上海醫(yī)學(xué)遺傳研究所，為衛(wèi)生部命名的上海醫(yī)學(xué)遺傳中心基因診斷部,，研究發(fā)展了一整套遺傳病分子診斷技術(shù),，在我國(guó)最早開(kāi)展了苯丙酮尿癥、血友病,、DMD等罕見(jiàn)遺傳病的基因診斷和產(chǎn)前診斷工作,。作為國(guó)家首批運(yùn)用高通量測(cè)序技術(shù)開(kāi)展遺傳病診斷的試點(diǎn)單位之一，上海市兒童醫(yī)院在兒童遺傳病的基因檢測(cè)領(lǐng)域居國(guó)內(nèi)領(lǐng)先地位,。
醫(yī)院作為上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院的臨床教學(xué)基地,，設(shè)有博士、碩士專(zhuān)業(yè)點(diǎn)及博士后流動(dòng)站,。與美國(guó),、加拿大、俄羅斯,、日本,、新加坡、韓國(guó),、英國(guó)等國(guó)的醫(yī)療機(jī)構(gòu)建立了緊密的合作關(guān)系,。近年來(lái)醫(yī)院承擔(dān)了國(guó)家“863”,、“973”重點(diǎn)攻關(guān)項(xiàng)目、國(guó)家重大專(zhuān)項(xiàng)課題項(xiàng)目,、國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目、教育部及上海市科委基金項(xiàng)目,、上海市衛(wèi)生健康委及申康醫(yī)院發(fā)展中心科研項(xiàng)目以及國(guó)際合作科研項(xiàng)目等的研究工作,。以著名科學(xué)家曾溢滔院士領(lǐng)銜的上海醫(yī)學(xué)遺傳研究所始終瞄準(zhǔn)本學(xué)科的國(guó)際前沿，近50次榮獲國(guó)家,、部委和上海市的重大成果獎(jiǎng)勵(lì),。