仁濟(jì)醫(yī)院建于1844年，是上海開埠后第一所西醫(yī)醫(yī)院。醫(yī)院目前由東西南北四個(gè)院區(qū)和上海市腫瘤研究所組成，是一個(gè)學(xué)科門類齊全，集醫(yī)療、教學(xué)、科研于一體的綜合性三級(jí)甲等醫(yī)院：東院位于浦東陸家嘴金融貿(mào)易區(qū)內(nèi)，于1999年10月建成投入使用，占地86875m2，建筑面積207740.74 m2；西院位于黃浦區(qū)中央商務(wù)區(qū)內(nèi)，毗鄰?fù)鉃嫉?811 m2，建筑面積39014.83 m2；南院位于閔行區(qū)浦江鎮(zhèn)，于2012年12月建成投入使用，占地50055 m2，建筑面積82590 m2；北院位于巨野路靈山路，占地6744 m2，建筑面積17553.82 m2，于2013年7月全面啟用；腫瘤所位于斜土路，總建筑面積7523 m2，由癌基因與相關(guān)基因國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、腫瘤流行病學(xué)研究室、十一個(gè)相關(guān)的研究課題組、輔助部門公共服務(wù)平臺(tái)與《腫瘤》雜志編輯部組成，于2010年10月與仁濟(jì)醫(yī)院正式“院所合一”，2019年完成整體轉(zhuǎn)隸，目前由市教委委托上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院管理，具體事務(wù)由仁濟(jì)醫(yī)院負(fù)責(zé)。
醫(yī)院東、西、北三個(gè)院區(qū)目前總核定床位1650張，南院核定床位600張。截止2019年底，醫(yī)院共有正式職工3458人（不含南院），其中正、副高級(jí)職稱專家477名；博導(dǎo)126名、碩導(dǎo)173名。醫(yī)院設(shè)有55個(gè)臨床醫(yī)技科室：消化科、心內(nèi)科、神經(jīng)外科、風(fēng)濕科、核醫(yī)學(xué)科、婦產(chǎn)科、婦科腫瘤科、泌尿科、腎臟科、麻醉科、疼痛科、重癥醫(yī)學(xué)科、放射科、胃腸外科、肝臟外科、膽胰外科、乳腺外科、血管外科、頭頸外科、血液科、老年病科、超聲醫(yī)學(xué)科、神經(jīng)內(nèi)科、內(nèi)分泌科、骨科、骨科-脊柱外科、骨科-骨關(guān)節(jié)外科、骨科-創(chuàng)傷骨科、呼吸科、耳鼻咽喉科、整形外科、眼科、生殖醫(yī)學(xué)科、放射診療科、藥學(xué)科、健康保健中心、輸血科、檢驗(yàn)科、兒科、康復(fù)科、口腔科、皮膚科、腫瘤科、急診科、胸外科、心血管外科、病理科、中醫(yī)科、臨床營養(yǎng)科、感染科、腫瘤介入科、功能神經(jīng)科、變態(tài)反應(yīng)科（過敏科）、心理醫(yī)學(xué)科、全科醫(yī)學(xué)科。
近年來，醫(yī)院申請(qǐng)到的科研項(xiàng)目及專利逐年遞增，包括國家級(jí)的973計(jì)劃、863計(jì)劃、國家自然基金（重大、重點(diǎn)、創(chuàng)新研究群體）項(xiàng)目等，其中2019年科研經(jīng)費(fèi)達(dá)1.38億元。醫(yī)院還獲得多項(xiàng)國家科技進(jìn)步獎(jiǎng)、中華醫(yī)學(xué)科技獎(jiǎng)、高等學(xué)校科技進(jìn)步獎(jiǎng)等；先后共有幾百人次入圍各級(jí)人才培養(yǎng)計(jì)劃，包括973首席科學(xué)家、長江特聘教授、衛(wèi)生部有突出貢獻(xiàn)中青年專家、國家杰出青年、上海市領(lǐng)軍人才等。醫(yī)院與加拿大、英國、美國、法國、比利時(shí)、德國、瑞士、挪威、澳大利亞、馬來西亞等近十個(gè)國家的二十多所醫(yī)學(xué)院校建立了學(xué)術(shù)交流和友好合作關(guān)系。