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高通量基因組分析系統(tǒng)采購順利完成
2014-12-03 11:03:56      點擊:

20141127日下午1400,政府采購項目評標會于我院科教樓719室順利舉行。成交公告已于上海市政府采購網(wǎng)公示,詳見鏈接:

http://www.ccgp-shanghai.gov.cn/bulletin.do?method=showbulletin&bulletin_id=2014023021

本次評標會涉及項目和部門:

序號           所屬項目                      部門

1         高通量基因組分析系統(tǒng)           免疫教研室

本次采購的高通量基因組分析系統(tǒng)是最新一代的二代測序,它采用了成熟的邊合成邊測序(SBS)的技術原理,是目前市面上最成熟,應用最廣泛的二代測序技術,目前已經(jīng)有超過4500篇文獻,包括了 NatureNature GeneticsSicenceCellNEJM等全球最頂級的雜志。此次購置的基因組分析系統(tǒng)反應速度更快,在2X150bp讀長下,一輪測序只需要29小時,最高通量可達到120GB,一輪反應即可完成一個人的全基因組測序(40X覆蓋),12個人的全外顯子組測序;每次運行可檢查400Mreads,可完成8個人的轉(zhuǎn)錄組測序,40個人的表達譜測序。系統(tǒng)將主要用于用于人的全基因組測序,人外顯子組測序,疾病相關基因靶向測序,已知物種再測序,全基因表達譜定量分析,全基因組小RNA分析,染色質(zhì)免疫共沉淀(ChIP)研究,微生物基因組分析,甲基化研究,轉(zhuǎn)錄組分析,宏基因組分析等。該系統(tǒng)的到位將有力地推動醫(yī)學及基礎生物學研究在各個方面的發(fā)展,促進學術的發(fā)展和人才的培養(yǎng)。

該設備將納入醫(yī)學院大型儀器平臺系統(tǒng),在滿足所在依托學科需求的同時,為其他部門及外單位提供相關服務。