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    今天是

薛定諤軟件采購順利完成
2014-04-15 13:45:37      點(diǎn)擊:

2014410日下午14004政府采購項(xiàng)目評(píng)標(biāo)會(huì)于我院科教樓719室順利舉行。成交公告已于中國政府采購網(wǎng)公示,詳見鏈接:

http://cpms.ccgp.gov.cn/Bid.do?action=showById&type=detail&bidId=11454769

本次評(píng)標(biāo)會(huì)涉及項(xiàng)目和部門:

序號(hào)           所屬項(xiàng)目                部門

1             薛定諤軟件          生理教研室于燁組  

本次采購的薛定諤軟件主要應(yīng)用于蛋白質(zhì)和多肽的分子模擬應(yīng)用。包含Maestro, Glide, LigPrep, Impact, Phase, Virtual Screening Workflow, Induced Fit Docking, QM-Polarized Ligand Docking, Covalent Docking, Biolumate, Prime, Desmond, MacroModel等模塊。Glide模塊包含三種模式,分別是:HTVS(高通量虛篩)模式,高精度對接上萬至幾十萬配體的SP(標(biāo)準(zhǔn)精度)模式,以及通過更大規(guī)模的采樣和更高級(jí)的打分函數(shù)進(jìn)一步消除假陽性以獲得更高富集率的XP(附加精度)模式。可以提供至少400個(gè)小分子的片段集(1-7個(gè)離子化或互變異構(gòu)體;6-37個(gè)原子;分子量范圍32-226)。LigPrep模塊能夠生成準(zhǔn)確的,能量最優(yōu)化的三維分子結(jié)構(gòu),糾正Lewis結(jié)構(gòu),消除配體分子的錯(cuò)誤以減少下游計(jì)算中的錯(cuò)誤。Phase模塊提供完整的藥效團(tuán)建模軟件工具,允許用戶在作業(yè)的所有步驟進(jìn)行精確的專家級(jí)設(shè)置,包括藥效團(tuán)評(píng)分、QSAR定量構(gòu)效關(guān)系建立和數(shù)據(jù)庫篩選等。能夠利用受體蛋白晶體的三維結(jié)構(gòu)信息來輔助產(chǎn)生藥效團(tuán),定義受體占據(jù)的空間區(qū)域,從而排除配體存在的可能空間,搜索活性命中物的同時(shí)由小分子結(jié)構(gòu)庫創(chuàng)建一個(gè)三維構(gòu)象數(shù)據(jù)庫。

這套軟件的購入有助于我院蛋白質(zhì)和多肽的分子模擬應(yīng)用研究的開展。