1月14日—18日 黨委向黨員干部傳達(dá)毛主席關(guān)于《清華大學(xué)物理教研組對待教師寧“左”勿右》的批示,，要求各級黨組織克服寧“左”勿右的思想,。

2月5日 根據(jù)中共中央《關(guān)于教育工作的指示》,，修訂教學(xué)計劃,，增加政治課,、勞動課,、體育課及中醫(yī)學(xué)的學(xué)時,，壓縮專業(yè)課時,。

2月19日 實行黨委領(lǐng)導(dǎo)下的院務(wù)委員會負(fù)責(zé)制,。院務(wù)委員會擴(kuò)大為87人,，關(guān)子展任主任委員。

3月16日 衛(wèi)生部副部長錢信忠來校視察中醫(yī)中藥及經(jīng)絡(luò)研究工作,。

3月 中國農(nóng)工民主黨上海第二醫(yī)學(xué)院支部成立,，魏指薪為主任委員。

4月6日—8日 衛(wèi)生部副部長徐運北來校視察教育科研等工作,。

5月19日 黨委常委會對常中方違法亂紀(jì)的錯誤進(jìn)行揭露批判,。隨后市委批準(zhǔn)撤銷常中方黨委副書記的職務(wù)，開除黨籍,。

5月26日 學(xué)校決定將醫(yī)療系分為一,、二兩個部，一部設(shè)在廣慈醫(yī)院,，二部設(shè)在仁濟(jì)醫(yī)院,，實行院系結(jié)合的教學(xué)管理體制。1961年3月正式實施,。

8月16日—24日 院第一屆黨員代表大會召開,，選出下一屆黨委會，關(guān)子展任黨委書記,，劉涌波任副書記,。

9月11日 黨委召開教職工大會，動員開展總路線學(xué)習(xí),，反右傾,，鼓干勁。

9月 蘭錫純主編國內(nèi)第一部《心臟外科學(xué)》由人民衛(wèi)生出版社出版,。

10月5日 學(xué)校醫(yī)療專業(yè)由五年制改為六年制,，于1960年執(zhí)行。

11月15日—22日 學(xué)院分別召開護(hù)士,、衛(wèi)技,、教輔、工勤人員代表大會,，動員反右傾,、鼓干勁，繼續(xù)“大躍進(jìn)”,。

11月28日 黨委擴(kuò)大會議傳達(dá)中共上海市委第一書記柯慶施關(guān)于“反右傾”報告,，此后有些黨員干部受到批判。

11月29日 學(xué)校召開中醫(yī)工作經(jīng)驗交流會,，鄺安堃等介紹中西醫(yī)結(jié)合工作的經(jīng)驗,，關(guān)子展作關(guān)于“創(chuàng)立新學(xué)派”的報告。

12月4日—13日 學(xué)校舉行第二次學(xué)術(shù)討論會,，除本校師生外,，著名醫(yī)學(xué)專家沉克菲,、應(yīng)元岳、程門雪等100余位來賓應(yīng)邀參加,。市科委副主任舒文到會講話。

12月 學(xué)院愛國衛(wèi)生運動委員會成立,，劉涌波任主任委員,。

本年 招收本科生584名，研究生5名,。畢業(yè)本科生350名,，研究生5名。

本年 胡文耀當(dāng)選為第二屆全國人大代表,。

本年 楊士達(dá),、蘭錫純、余賀任第三屆全國政協(xié)委員,，楊士達(dá)當(dāng)選政協(xié)常委,。