1月4日 上海市教育與科研計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)（SHERNET）在交通大學(xué)網(wǎng)絡(luò)管理中心并網(wǎng)聯(lián)通，二醫(yī)大成為首批入網(wǎng)高校之一,。

1月30日 國(guó)家科委副主席鄧楠在市科委主任華裕達(dá)陪同下視察上海血液學(xué)研究所,。

2月 張滌生當(dāng)選為中國(guó)工程院院士。

4月30日 中共中央政治局候補(bǔ)委員,、書記處書記溫家寶視察上海血液學(xué)研究所,。

5月9日 學(xué)校成立成人教育學(xué)院。

5月 瑞金醫(yī)院主辦的《外科》雜志創(chuàng)刊（季刊）,，主編林言箴,。編輯部設(shè)在瑞金醫(yī)院。

6月12日 校學(xué)位評(píng)定委員會(huì)討論通過(guò)17人為學(xué)校第二批自行審定的博士生導(dǎo)師,。

6月25日 國(guó)家教委副主任韋鈺來(lái)校檢查“211工程”部門預(yù)審準(zhǔn)備工作,，并在學(xué)校黨政領(lǐng)導(dǎo)陪同下視察瑞金醫(yī)院和上海血液學(xué)研究所。

7月3日—5日 經(jīng)國(guó)家教委同意,，由上海市人民政府組織的專家評(píng)審委員會(huì)對(duì)本校申請(qǐng)進(jìn)入“211工程”進(jìn)行了部門預(yù)審,。以中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院院長(zhǎng)、中國(guó)工程院院士巴德年教授為主任的評(píng)審委員會(huì)成員,，認(rèn)為上海二醫(yī)大已成為“國(guó)內(nèi)堪稱一流的醫(yī)科大學(xué)”,，一致同意列入國(guó)家“211工程”建設(shè)項(xiàng)目。

8月30日 第三屆求是科技基金獎(jiǎng)在北京頒發(fā),，王振義被授予唯一的“杰出科學(xué)家獎(jiǎng)”,，獲100萬(wàn)元人民幣獎(jiǎng)金。王振義將獎(jiǎng)金捐獻(xiàn)給學(xué)校與瑞金醫(yī)院各40萬(wàn)元,，捐獻(xiàn)給上海血液學(xué)研究所10萬(wàn)元,，建立獎(jiǎng)勵(lì)基金，獎(jiǎng)勵(lì)在醫(yī)教研工作中做出突出成績(jī)和貢獻(xiàn)的教職醫(yī)務(wù)員工和研究生,。

9月10日 學(xué)校隆重慶祝第十二屆教師節(jié),，徐匡迪市長(zhǎng)、左煥琛副市長(zhǎng)來(lái)校視察慰問(wèn),。

9月25日 國(guó)務(wù)委員,、國(guó)家科委主任宋健在副市長(zhǎng)左煥琛陪同下視察上海血液學(xué)研究所。

10月28日 瑞金醫(yī)院與法國(guó)巴黎衛(wèi)生局簽署人員培訓(xùn)和學(xué)術(shù)交流協(xié)議,。