世界衛(wèi)生組織提出抗微生物耐藥性 (AMR) 是本世紀人類健康最嚴重的威脅之一,，尤其是在“后抗生素時代”新抗生素研發(fā)顯著滯后于耐藥細菌出現(xiàn)的背景下。現(xiàn)今,，全球73%的抗微生物藥物被用于促進食用動物（主要是雞和豬）生長和疾病的預防,，食用動物被認為是AMR的重要貯存宿主和來源。因此,，開展食用動物源細菌的耐藥性監(jiān)測對于AMR的控制具有重要意義,。同時，這也是整合動物,、環(huán)境和人類三個層面的全健康理念的重要范疇之一,。崇明島位于長江入海口,，是全國第三大島嶼,，也是上海市重要的食品來源基地之一。崇明島相對獨立的地理優(yōu)勢和較為完善的食用動物養(yǎng)殖體系為AMR防控相關(guān)的實踐提供了較理想的條件,。
近期,，上海交通大學醫(yī)學院全球健康學院動物健康與食品安全系在Infectious Diseases of Poverty雜志發(fā)表了“Dynamic antimicrobial resistant patterns of Escherichia coli from healthy poultry and swine over 10 years in Chongming Island, Shanghai”的研究論文，依托于交大全健康研究中心崇明基地，系統(tǒng)分析崇明島2009-2021年的雞和豬來源大腸埃希菌耐藥數(shù)據(jù),，探究了崇明島食用動物源大腸埃希菌AMR的動態(tài)模式,。
本研究通過收集崇明島2009-2021年4個雞養(yǎng)殖場和9個豬養(yǎng)殖場945株健康動物源大腸埃希菌菌株，選擇常用的10類抗菌藥物的15種抗菌藥物通過微量肉湯稀釋法測定菌株的耐藥表型,。利用描述性方法,、廣義線性混合模型和共現(xiàn)分析對現(xiàn)有的表型數(shù)據(jù)進行分析,。
數(shù)據(jù)分析結(jié)果顯示945株菌株中,，863株為多重耐藥(MDR)菌株（對三類及以上抗菌藥物耐藥），集中在4-8類,。豬和雞來源菌株對四環(huán)素類,、氯霉素類、磺胺類,、青霉素類和氨基糖苷類（僅豬來源菌株）的耐藥率均超過70.0%,，其中豬來源菌株對氯霉素類耐藥率最高，為92.6%,，雞來源菌株對四環(huán)素耐藥率（86.4%）最高,。豬來源菌株對青霉素類、氨基糖苷類,、四環(huán)素類,、氯霉素類和多肽類的耐藥率顯著高于雞來源菌株，而雞來源菌株對氯霉素類的耐藥率顯著高于豬來源菌株,。945株菌株中僅發(fā)現(xiàn)1株對碳青霉類（美羅培南）耐藥菌株,。耐藥率動態(tài)變化分析表明，雞和豬來源菌株對多肽類（黏菌素）的耐藥率均呈現(xiàn)下降趨勢,，2016年后耐藥率基本降為0,。豬源菌株對其他7類（碳青霉烯類和青霉素類除外）藥物的耐藥率基本呈現(xiàn)下降趨勢，尤其2016年以后,。而雞來源的菌株對7類藥物的耐藥率呈現(xiàn)不同的下降趨勢,。對多重耐藥菌株的深入研究發(fā)現(xiàn)，部分多重耐藥菌株在多個年份出現(xiàn),，提示可能一直在養(yǎng)殖場環(huán)境中存在,但雞和豬來源菌株的多重耐藥組合模式和出現(xiàn)的年份并不相同,。通過泊松分布廣義線性模型（GLMMs）對AMR carriage檢驗發(fā)現(xiàn)，2016-2021年的菌株AMR carriage顯著低于2009（OR<1）,，提示MDR出現(xiàn)風險正在降低,。通過共現(xiàn)分析發(fā)現(xiàn)，青霉素類-氯霉素類-氟喹諾酮類是雞菌株中最常見的多重耐藥組合,，氨基糖苷類-四環(huán)素類-磺胺類-氯霉素類是豬菌株中最常見的耐藥組合,。
本研究表明，崇明島食用動物源細菌多重耐藥仍然是一個亟待解決的問題。但崇明島動物源細菌耐藥已經(jīng)出現(xiàn)明顯好轉(zhuǎn)的趨勢,，反映在頭孢類,、黏菌素和碳青霉烯類的低耐藥率；其他類藥物耐藥率下降的趨勢（尤其是豬）以及MDR流行率的降低,，同時,，本研究結(jié)果也 顯示豬和雞來源菌株不同的耐藥動態(tài)變化模式。本研究為崇明全球生態(tài)島制定AMR處置策略提供參考和依據(jù),。
全球健康學院朱泳璋副教授,、郭曉奎教授和上海市動物疫控中心黃仕新研究員為該論文的共同通訊作者。本研究得到了國家自然科學基金（No：32170141）,、中華醫(yī)學會（No.20-365）和上海交通大學綜合創(chuàng)新基金（No.2020-01）的支持,。
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