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Chemical Society Reviews|全球健康學(xué)院環(huán)境健康與生態(tài)安全系殷堃團(tuán)隊(duì)發(fā)表綜述:基于CRISPR/Cas系統(tǒng)的無(wú)擴(kuò)增檢測(cè)技術(shù)

作者:李慧敏,、殷堃   發(fā)布時(shí)間 :2023年02月10日

快速準(zhǔn)確的分子診斷在生命科學(xué),、食品安全、環(huán)境監(jiān)測(cè)等領(lǐng)域發(fā)揮重要作用,?;?/span>PCR或下一代測(cè)序技術(shù)的方法具有高準(zhǔn)確度,但存在反應(yīng)耗時(shí)長(zhǎng),、分析程序復(fù)雜,、儀器體積大和依賴專業(yè)人員操作等問(wèn)題,。近年來(lái),,基于規(guī)律成簇的間隔短回文重復(fù)序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)/CRIPSR相關(guān)(CRISPR-associated,,Cas)系統(tǒng)的檢測(cè)技術(shù)快速發(fā)展,,由于其具有強(qiáng)特異性和可編程性,易與現(xiàn)場(chǎng)即時(shí)監(jiān)測(cè)設(shè)備相結(jié)合,,已在分子診斷領(lǐng)域展現(xiàn)出巨大潛力,。然而,基于CRISPR/Cas的檢測(cè)方法通常需要核酸靶標(biāo)預(yù)擴(kuò)增步驟來(lái)提高分析物的濃度,,延長(zhǎng)了檢測(cè)時(shí)間,,并增加氣溶膠污染的風(fēng)險(xiǎn),從而影響檢測(cè)準(zhǔn)確性,。因此,,各種基于CRISPR/Cas的無(wú)靶標(biāo)擴(kuò)增amplification-free)檢測(cè)策略被開(kāi)發(fā)出來(lái),,旨在克服上述局限性,大限度地減少因缺乏預(yù)擴(kuò)增而導(dǎo)致的靈敏度損失,,并利于非核酸靶標(biāo)檢測(cè)和便攜式設(shè)備集成,。

近期,上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院-國(guó)家熱帶病研究中心全球健康學(xué)院環(huán)境健康與生態(tài)安全系碩士研究生李慧敏等在Chemical Society Reviews (IF=60.615) 雜志發(fā)表了“Amplification-free CRISPR/Cas detection technology: challenges, strategies, and perspectives的綜述性文章,,對(duì)基于CRISPR/Cas系統(tǒng)的無(wú)擴(kuò)增檢測(cè)技術(shù)的近期成果進(jìn)行了系統(tǒng)性總結(jié)歸納,,并提出了該領(lǐng)域面臨的挑戰(zhàn)以及未來(lái)展望。

本文首先綜述了基于無(wú)擴(kuò)增的CRISPR/Cas檢測(cè)技術(shù)的發(fā)展現(xiàn)狀和面臨的挑戰(zhàn),,進(jìn)而重點(diǎn)介紹了提升無(wú)擴(kuò)增CRISPR/ Cas技術(shù)檢測(cè)靈敏度的四種主要策略優(yōu)化CRISPR/Cas反應(yīng)的關(guān)鍵參數(shù),、數(shù)字化靈敏檢測(cè)平臺(tái)偶聯(lián)其他靈敏信號(hào)傳感器以及設(shè)計(jì)級(jí)聯(lián)反應(yīng)實(shí)現(xiàn)輸出信號(hào)放大,。最后,,本文進(jìn)一步討論了基于無(wú)擴(kuò)增CRISPR/Cas檢測(cè)技術(shù)未來(lái)展望包括實(shí)現(xiàn)各獨(dú)立反應(yīng)標(biāo)準(zhǔn)化,、降低檢測(cè)成本,、形成整合的檢測(cè)平臺(tái)以適應(yīng)現(xiàn)場(chǎng)即時(shí)檢測(cè)的需求,以及無(wú)擴(kuò)增靶標(biāo)多重檢測(cè),,這些進(jìn)一步優(yōu)化將有助于開(kāi)發(fā)更有效的生物傳感策略,,使CRISPR/Cas檢測(cè)技術(shù)成為真正理想的分子診斷工具

上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院-國(guó)家熱帶病研究中心全球健康學(xué)院碩士研究生李慧敏和碩士研究生解藝為共同第一作者,,全球健康學(xué)院殷堃研究員,、胡沁沁副研究員和郭曉奎教授為該論文的共同通訊作者本研究得到國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目22104090),、上海市自然科學(xué)基金項(xiàng)目22ZR1436200)和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)國(guó)家重大科技基礎(chǔ)設(shè)施(上海)(TMSK-2021-114的支持,。


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