為加強(qiáng)全球健康學(xué)院全健康公共技術(shù)平臺(tái)建設(shè),，有力推進(jìn)學(xué)院探索病原在人類-動(dòng)物-環(huán)境界面的發(fā)生與傳播機(jī)制,、防控救治,、資源調(diào)配等方面的科學(xué)研究,，近日全球健康學(xué)院配備了一套三代全基因組測序儀,。2023年5月5日上午,，學(xué)院特邀納米孔測序技術(shù)工程師：上海柏辰生物科技有限公司ONT項(xiàng)目組邵林主講全健康論壇第22講,，主題是“Oxford Nanopore測序技術(shù)最新研究進(jìn)展及場景應(yīng)用”,，全球健康各院系師生參加本次論壇,。
工程師首先向大家介紹了目前在科研過程中較為常見的幾項(xiàng)測序技術(shù),，概括了一代、二代、三代測序的各自特點(diǎn),。其中,，三代測序如PB，具有讀長較長,，準(zhǔn)確度較準(zhǔn),，但操作復(fù)雜、周期長的特點(diǎn),，同時(shí)指出Nanopore技術(shù)基于電流信號(hào)的方式,，具有讀長無限制，通量高,、準(zhǔn)確度較準(zhǔn),、且操作簡單的特點(diǎn)，可以產(chǎn)生充足的基因組數(shù)據(jù)信息,。接著,，他展示了Nanopore測序技術(shù)在人類健康、技術(shù)研究,、動(dòng)植物基因組組裝,、病原微生物、環(huán)境微生物,、癌癥基因組以及教育等方面的具體應(yīng)用,。詳細(xì)闡述了Nanopore納米孔測序的建庫原理，其核心是蛋白納米孔,，人為改造后僅允許DNA/RNA單鏈通過,，通過馬達(dá)蛋白來進(jìn)行解旋和控制DNA/RNA單鏈通過納米孔的速度，過孔同時(shí)產(chǎn)生特異性的電流信號(hào),，通過內(nèi)置算法,，實(shí)時(shí)識(shí)別堿基。因此具有測序片段長度無限制,、實(shí)時(shí)分析的特點(diǎn),。
而后，工程師簡要描述了通過連接測序試劑盒來進(jìn)行DNA文庫制備的操作方法,，主要原理是提取高分子量基因組DNA進(jìn)行末端修復(fù),，再連接測序接頭，然后上機(jī)檢測,。此外,，就GridION儀器的詳細(xì)介紹、操作步驟包括芯片的質(zhì)檢,、上機(jī)操作,、儀器的控制和數(shù)據(jù)的轉(zhuǎn)化、實(shí)操運(yùn)行及軟件的使用展開了詳細(xì)的介紹。
最后,，工程師介紹了芯片的具體區(qū)域劃分及芯片的使用方法和注意事項(xiàng),，并針對(duì)大家提出的問題進(jìn)行了詳細(xì)的解答。在工程師的指導(dǎo)下,，全球健康師生完成了第一次的DNA文庫制備和上機(jī)操作,，取得圓滿成功。
此次論壇的順利開展豐富了學(xué)院師生對(duì)最新測序技術(shù)的了解,，為我院三代測序平臺(tái)的建立打下堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ),。下一步，全球健康學(xué)院公共技術(shù)平臺(tái)將繼續(xù)扎實(shí)開展人員培訓(xùn),，儲(chǔ)備技術(shù)力量,，為學(xué)院全健康科學(xué)研究提供強(qiáng)力支撐。
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