為加強全球健康學(xué)院全健康公共技術(shù)平臺建設(shè)，有力推進學(xué)院探索病原在人類-動物-環(huán)境界面的發(fā)生與傳播機制、防控救治、資源調(diào)配等方面的科學(xué)研究，近日全球健康學(xué)院配備了一套三代全基因組測序儀。2023年5月5日上午，學(xué)院特邀納米孔測序技術(shù)工程師：上海柏辰生物科技有限公司ONT項目組邵林主講全健康論壇第22講，主題是“Oxford Nanopore測序技術(shù)最新研究進展及場景應(yīng)用”，全球健康各院系師生參加本次論壇。
工程師首先向大家介紹了目前在科研過程中較為常見的幾項測序技術(shù)，概括了一代、二代、三代測序的各自特點。其中，三代測序如PB，具有讀長較長，準確度較準，但操作復(fù)雜、周期長的特點，同時指出Nanopore技術(shù)基于電流信號的方式，具有讀長無限制，通量高、準確度較準、且操作簡單的特點，可以產(chǎn)生充足的基因組數(shù)據(jù)信息。接著，他展示了Nanopore測序技術(shù)在人類健康、技術(shù)研究、動植物基因組組裝、病原微生物、環(huán)境微生物、癌癥基因組以及教育等方面的具體應(yīng)用。詳細闡述了Nanopore納米孔測序的建庫原理，其核心是蛋白納米孔，人為改造后僅允許DNA/RNA單鏈通過，通過馬達蛋白來進行解旋和控制DNA/RNA單鏈通過納米孔的速度，過孔同時產(chǎn)生特異性的電流信號，通過內(nèi)置算法，實時識別堿基。因此具有測序片段長度無限制、實時分析的特點。
而后，工程師簡要描述了通過連接測序試劑盒來進行DNA文庫制備的操作方法，主要原理是提取高分子量基因組DNA進行末端修復(fù)，再連接測序接頭，然后上機檢測。此外，就GridION儀器的詳細介紹、操作步驟包括芯片的質(zhì)檢、上機操作、儀器的控制和數(shù)據(jù)的轉(zhuǎn)化、實操運行及軟件的使用展開了詳細的介紹。
最后，工程師介紹了芯片的具體區(qū)域劃分及芯片的使用方法和注意事項，并針對大家提出的問題進行了詳細的解答。在工程師的指導(dǎo)下，全球健康師生完成了第一次的DNA文庫制備和上機操作，取得圓滿成功。
此次論壇的順利開展豐富了學(xué)院師生對最新測序技術(shù)的了解，為我院三代測序平臺的建立打下堅實基礎(chǔ)。下一步，全球健康學(xué)院公共技術(shù)平臺將繼續(xù)扎實開展人員培訓(xùn)，儲備技術(shù)力量，為學(xué)院全健康科學(xué)研究提供強力支撐。
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