上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院的前身為上海第二醫(yī)科大學(xué)。原上海第二醫(yī)科大學(xué)是由圣約翰大學(xué)醫(yī)學(xué)院(1896-1952)、震旦大學(xué)醫(yī)學(xué)院(1911-1952)、同德醫(yī)學(xué)院(1918-1952)于1952年全國高等學(xué)校院系調(diào)整時(shí)合并組成,。2005年7月18日，上海交通大學(xué)與上海第二醫(yī)科大學(xué)合并,，新的上海交大醫(yī)學(xué)院成立,，嶄新的上海交大醫(yī)學(xué)院由教育部、上海市政府重點(diǎn)共建,。
一,、1879-1952年
圣約翰大學(xué)醫(yī)學(xué)院
圣約翰大學(xué)是美國基督教圣公會(huì)建于上海的一所教會(huì)大學(xué),。建于1879年,，1952年撤消,，歷時(shí)73年。在上海教會(huì)大學(xué)中歷史最為悠久,。
1879年—1896年,，創(chuàng)建圣約翰書院，創(chuàng)辦人施約瑟,。建校初期相當(dāng)于中等學(xué)校,。1888年起，卜舫濟(jì)任校長(zhǎng)（至1941年）,。
1880年，文恒理創(chuàng)辦虹口同仁醫(yī)院醫(yī)學(xué)班,。
1896年—1906年,，改組為圣約翰學(xué)校，設(shè)置醫(yī)科,、文科,、理科，學(xué)制先后改為四年,。文恒理為醫(yī)科主任,。
1906年—1952年，注冊(cè)學(xué)校名為圣約翰大學(xué),，先后成立理學(xué)院,、醫(yī)學(xué)院、工學(xué)院,、神學(xué)院,、農(nóng)學(xué)院。
1906年,，圣約翰大學(xué)醫(yī)學(xué)部,，學(xué)制改為七年，畢業(yè)者授予博士學(xué)位,。
1914年,，廣州賓夕法尼亞醫(yī)學(xué)院和圣約翰醫(yī)科合并，成立圣約翰大學(xué)賓夕法尼亞醫(yī)學(xué)院,，學(xué)制七年,。先后由莫約西、刁信德任院長(zhǎng),。
1947年,，圣約翰大學(xué)醫(yī)學(xué)院成立,，倪葆春出任院長(zhǎng)。
震旦大學(xué)醫(yī)學(xué)院
震旦大學(xué)始于馬相伯創(chuàng)辦的震旦學(xué)院,，1902年末,，蔡元培等請(qǐng)馬相伯建學(xué)院，馬相伯捐三千畝地產(chǎn)予以資助,，并請(qǐng)?zhí)熘鹘谭▏d會(huì)協(xié)助,。
1903年—1912年,，震旦學(xué)院,，校址在徐家匯天文臺(tái)舊址，設(shè)“文學(xué)”,、“質(zhì)學(xué)”（即科學(xué)）兩門課程。1908年起設(shè)文,、理兩科。
1903年2月,，震旦學(xué)院正式開學(xué)，馬相伯自任總教習(xí),，親定章程,，確定震旦辦學(xué)宗旨,。
1905年2月,，法國耶穌會(huì)傳教士篡改原定章程，學(xué)生憤而集體退學(xué),，馬相伯辭職,，震旦學(xué)院停辦。
1905年8月,，震旦學(xué)院在法國耶穌會(huì)主辦下重新開辦,，成為天主教法國耶穌教會(huì)直接控制的大學(xué)。
1912年—1928年,，震旦大學(xué)院,，遷址盧家灣呂班路（今重慶南路）。1914年起,，分設(shè)法政法政文學(xué)科,、算術(shù)工學(xué)科、博物醫(yī)藥科。后改稱法政科,、工程科,、醫(yī)學(xué)科。
1911年,，設(shè)震旦大學(xué)院醫(yī)學(xué)先修科。醫(yī)學(xué)先修科兩年,，臨床實(shí)習(xí)四年畢業(yè),。教學(xué)醫(yī)院為廣慈醫(yī)院（瑞金醫(yī)院）,、安當(dāng)醫(yī)院（盧灣區(qū)中心醫(yī)院）,。
1912年，法籍傳教士孔道明任震旦學(xué)院院長(zhǎng),。
1914年,，正式設(shè)博物醫(yī)藥科，學(xué)制四年,。
1915年,，改為醫(yī)學(xué)科，學(xué)制六年,。畢業(yè)授醫(yī)學(xué)博士學(xué)位,。
1928年—1952年，震旦大學(xué),，1932年起分設(shè)醫(yī)學(xué)院,、法學(xué)院、建工學(xué)院,。
1932年,，震旦大學(xué)獲教育部批準(zhǔn)立案，將醫(yī)科改為醫(yī)學(xué)院,。院長(zhǎng)由法國駐華使館醫(yī)師貝熙業(yè)兼任,。增設(shè)牙醫(yī)系，學(xué)制四年,。
1938年,，富萊梅傳教士（法國里昂大學(xué)醫(yī)學(xué)院病理學(xué)博士）繼任院長(zhǎng)。
1948年,，牙醫(yī)系改稱牙醫(yī)學(xué)院,，學(xué)制六年。
1950年,，牙醫(yī)學(xué)院復(fù)稱牙醫(yī)系,。
1951年，上海牙醫(yī)專科學(xué)校并入震旦大學(xué)牙醫(yī)系,。
同德醫(yī)學(xué)院
同德醫(yī)學(xué)院建于1918年,，1952年撤消，歷時(shí)34年,，它是由中國人在上海自辦的一所私立高等醫(yī)學(xué)院校,。
1918年，中華德醫(yī)學(xué)會(huì)會(huì)員沈云扉創(chuàng)意開辦醫(yī)科學(xué)校,。同年8月建校定名為“同德醫(yī)學(xué)專門學(xué)校”,。德醫(yī)學(xué)會(huì)會(huì)長(zhǎng)江逢治任校長(zhǎng)，沈云扉任教務(wù)長(zhǎng),。設(shè)醫(yī)療專業(yè)?？疲瑢W(xué)制五年,。9月正式開學(xué),。初建時(shí)租淮陰路19號(hào)為校舍。
1919年,，學(xué)校開設(shè)附屬醫(yī)院于青島路,。
1920年，德醫(yī)學(xué)會(huì)決定,，學(xué)校獨(dú)立,，聘社會(huì)名流、學(xué)者組成董事會(huì),，原維新派領(lǐng)袖康有為任主席董事,。
1925年，黃楚九出任主席董事,，龐京周任校長(zhǎng),。學(xué)校借同孚路67弄1號(hào)為校址。
1932年,，學(xué)校改組董事會(huì),，邵力子任主席董事，顧毓琦任院長(zhǎng),。以募建所得購置翔殷路五畝土地,，建造新校舍。
1935年,，竣工啟用新校舍,，9月學(xué)校正式更名私立同德醫(yī)學(xué)院，學(xué)制改為六年,。
二,、1952年--1985年
上海第二醫(yī)學(xué)院
1952年,，9月，華東軍政委員會(huì)衛(wèi)生部根據(jù)中央教育部關(guān)于全國高等學(xué)校院系調(diào)整的決定,，將上海圣約翰大學(xué)醫(yī)學(xué)院,、震旦大學(xué)醫(yī)學(xué)院及同德醫(yī)學(xué)院合并成立上海第二醫(yī)學(xué)院。廣慈醫(yī)院（現(xiàn)瑞金醫(yī)院）,、仁濟(jì)醫(yī)院劃為上海第二醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院,。10月24日，舉行上海第二醫(yī)學(xué)院成立暨首屆開學(xué)典禮,。宮乃泉兼任院長(zhǎng),，胡文耀、王樂三,、倪葆春,、楊士達(dá)任副院長(zhǎng)。12月,，中共中央華東局組織部批復(fù)同意成立中共上海第二醫(yī)學(xué)院委員會(huì),，宮乃泉為黨委第一書記,，王樂三為第二書記,。
1953年，廣慈護(hù)校與仁濟(jì)護(hù)校合并建成上海第二醫(yī)學(xué)院附屬護(hù)士學(xué)校,。
1954年,，宏仁醫(yī)院劃為上海第二醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院。
1955年,，成立基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)部,、醫(yī)療系和口腔系。醫(yī)學(xué)院首次招收研究生,。
1956年,，第九人民醫(yī)院（原名伯特利醫(yī)院）劃歸二醫(yī)附屬醫(yī)院。宏仁醫(yī)院改組為胸科醫(yī)院,，劃歸市衛(wèi)生局,。
1957年，二醫(yī)護(hù)校下放,，由廣慈醫(yī)院領(lǐng)導(dǎo),，更名為廣慈醫(yī)院護(hù)士學(xué)校。
1958年,，國家實(shí)行高校管理體制改革,，第二醫(yī)學(xué)院成為上海市的地方院校。關(guān)子展任黨委書記,。同年,，新華醫(yī)院建立，規(guī)劃為附屬醫(yī)院，作為兒科系教育基地,。上海第四護(hù)士學(xué)校劃歸新華醫(yī)院領(lǐng)導(dǎo),，改名為“上海第二醫(yī)學(xué)院附屬新華醫(yī)院護(hù)士學(xué)校”。上海市傷科研究所,、校夜大學(xué),、上海市高血壓研究所相繼成立。
衛(wèi)生部批準(zhǔn)兒科專業(yè)學(xué)制由五年改為六年,。第九人民醫(yī)院（原名伯特利醫(yī)院）歸還上海市衛(wèi)生局領(lǐng)導(dǎo),。
1959年，學(xué)校決定將醫(yī)療系分為一,、二兩個(gè)部,，一部設(shè)在廣慈醫(yī)院，二部設(shè)在仁濟(jì)醫(yī)院,。1961年3月正式實(shí)施,。
1962年，上海醫(yī)學(xué)?？茖W(xué)校停辦,，并入上海第二醫(yī)學(xué)院。6月,，新華醫(yī)院小兒科被命名為新華兒童醫(yī)院,。
1964年，第九人民醫(yī)院重新劃歸二醫(yī)為附屬醫(yī)院,，作為口腔系教學(xué)基地,。
1965年，學(xué)校受市衛(wèi)生局委托在嘉定縣開辦上海半農(nóng)半讀醫(yī)學(xué)?？茖W(xué)校（至1972年撤銷）,。
1969年，二醫(yī)在皖南績(jī)溪縣,、寧國縣籌建后方醫(yī)院,。1971年建成，后方瑞金醫(yī)院,、后方古田醫(yī)院,。1984年，兩院合并,，改名為上海第二醫(yī)學(xué)院附屬后方醫(yī)院,。1986年，后方醫(yī)院無償移交當(dāng)?shù)卣褂谩?/font>
1970年,，開始舉辦醫(yī)科二年制試點(diǎn)班,，招收第一批工農(nóng)兵學(xué)員,。六年共有畢業(yè)生2801人。
1972年,，根據(jù)國家統(tǒng)一規(guī)定,，學(xué)校正式招收醫(yī)科三年制工農(nóng)兵學(xué)員。
1975年,，經(jīng)市文教組同意,，學(xué)校開設(shè)法語培訓(xùn)班，從應(yīng)屆中學(xué)生中招收50名學(xué)員,，1978年10月作為大專生畢業(yè),。12月，學(xué)?；謴?fù)研究生教育,，招收試點(diǎn)班研究生22名，學(xué)制兩年,。
1976年,，開始接收外國留學(xué)生。第一批9名本科留學(xué)生入學(xué),。
1977年,，全國恢復(fù)高等院校統(tǒng)一招生考試制度，學(xué)校招收本科生570名,。
1978年,，市委任命蘭錫純?yōu)樯虾５诙t(yī)學(xué)院院長(zhǎng)。市計(jì)委批準(zhǔn)建設(shè)寶鋼醫(yī)院計(jì)劃,，并明確寶鋼醫(yī)院為上海第二醫(yī)學(xué)院教學(xué)醫(yī)院。上海市兒科醫(yī)學(xué)研究所成立,，所長(zhǎng)高鏡朗,、郭迪。學(xué)校開始招收三年制碩士研究生,。1979年,，上海市內(nèi)分泌研究所、上海市免疫研究所分別成立,。市教衛(wèi)辦批復(fù),，同意撤銷上海第二醫(yī)學(xué)院衛(wèi)校，校舍移交嘉定縣,，原該校藥劑專業(yè)并入新華衛(wèi)生學(xué)校,。
1980年，國家教育部確定上海第二醫(yī)學(xué)院為全國重點(diǎn)高校,。衛(wèi)生部同意二醫(yī)恢復(fù)“醫(yī)學(xué)法語”專業(yè),，學(xué)制六年,。二醫(yī)夜大學(xué)恢復(fù)招生，開設(shè)五年制臨床專業(yè),。上海市免疫研究所被世界衛(wèi)生組織命名為免疫遺傳學(xué)研究合作中心,。
1981年，新華衛(wèi)生學(xué)校改為“上海第二醫(yī)學(xué)院新華衛(wèi)生學(xué)校”,，并經(jīng)教育部審定為全國重點(diǎn)中等專業(yè)學(xué)校,。二醫(yī)大在上海市第六人民醫(yī)院建立醫(yī)學(xué)系三部。同年,，教育部批準(zhǔn),，二醫(yī)醫(yī)學(xué)、兒科,、口腔三個(gè)專業(yè)由五年制改為六年制,。國務(wù)院學(xué)位委員會(huì)批準(zhǔn)二醫(yī)為首批博士、碩士學(xué)位授予單位,，設(shè)6個(gè)博士點(diǎn),、21個(gè)碩士點(diǎn)。
1982年,，二醫(yī)大黨委決定,，在寶鋼醫(yī)院成立醫(yī)學(xué)系四部。我院與上?？萍即髮W(xué)合辦生物醫(yī)學(xué)工程專業(yè),。同年，上海市口腔醫(yī)學(xué)研究所成立,。
1983年,，我院編寫的《醫(yī)德學(xué)概論》經(jīng)衛(wèi)生部推薦由人民衛(wèi)生出版社正式出版，這是建國以來國內(nèi)第一本醫(yī)學(xué)職業(yè)道德專著,。
1984年,，二醫(yī)成立檢驗(yàn)系和生物醫(yī)學(xué)工程系。9月,，上?？萍即髮W(xué)、上海第二醫(yī)學(xué)院聯(lián)合建立上海生物醫(yī)學(xué)工程研究所,。本年度,，成立上海第二醫(yī)學(xué)院高級(jí)醫(yī)師進(jìn)修部，上海市消化疾病研究所,。
三,、1985年—2005年
上海第二醫(yī)科大學(xué)
1985年，市政府批準(zhǔn)上海第二醫(yī)學(xué)院更名為上海第二醫(yī)科大學(xué),。上海市教衛(wèi)黨委決定二醫(yī)正式實(shí)行院長(zhǎng)負(fù)責(zé)制,。院長(zhǎng)對(duì)二醫(yī)的行政實(shí)行統(tǒng)一領(lǐng)導(dǎo),，對(duì)醫(yī)、教,、研各項(xiàng)工作全面負(fù)責(zé),。黨委對(duì)行政實(shí)行保證監(jiān)督。
3月衛(wèi)生部批準(zhǔn)成立上海第二醫(yī)學(xué)院臨床藥理研究中心,。5月,，國家教委批準(zhǔn)二醫(yī)增設(shè)高級(jí)護(hù)理專業(yè)，學(xué)制五年,。市高教局批準(zhǔn)成立高級(jí)護(hù)理系,。5月，學(xué)校建立社會(huì)科學(xué)系,。本年度,，二醫(yī)大醫(yī)學(xué)生物工程研究中心、上海第二醫(yī)科大學(xué)傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)研究中心分別成立,。
1986年,，經(jīng)國家教委批準(zhǔn)，建立衛(wèi)生管理專業(yè),。上海市計(jì)劃生育委員會(huì)同意二醫(yī)大成立上海市生殖醫(yī)學(xué)研究與培訓(xùn)中心,。學(xué)校設(shè)置成人教育處，撤銷原教務(wù)處下屬業(yè)余教育科建制,。本年度,，學(xué)校首次招收醫(yī)學(xué)臨床博士生。
1987年,，衛(wèi)生部同意在上海第二醫(yī)科大學(xué)建立“全國醫(yī)學(xué)法語培訓(xùn)中心”,。同年，上海血液研究所,、二醫(yī)大口腔醫(yī)學(xué)院分別成立,。
1988年，經(jīng)國家教委批準(zhǔn)上海第二醫(yī)科大學(xué)為試辦七年制的高等醫(yī)學(xué)院校之一,。學(xué)校開始招收外國碩士研究生。學(xué)校決定成立社會(huì)科學(xué)部和衛(wèi)生管理系,，撤銷原社會(huì)科學(xué)系,。二醫(yī)大與復(fù)旦大學(xué)建立校際合作，培養(yǎng)臨床醫(yī)學(xué)七年制及五年制英文班學(xué)生,。市高教局批準(zhǔn)二醫(yī)大設(shè)置醫(yī)學(xué)營養(yǎng)專業(yè),，學(xué)制五年。同年,，上海市整復(fù)外科研究所,、上海市燒傷研究所分別成立,。免疫研究所更名為“上海市免疫遺傳學(xué)與免疫病理學(xué)合作中心”。
1989年,，經(jīng)市高教局批準(zhǔn),，成立上海第二醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院。市教衛(wèi)辦批復(fù),，同意上海第二醫(yī)科大學(xué)附屬新華衛(wèi)校,、瑞金醫(yī)院護(hù)校及九院護(hù)校合并為上海第二醫(yī)科大學(xué)附屬衛(wèi)生學(xué)校。1988年6月至1989年6月先后為上海市第六人民醫(yī)院,，上海市紡織局第一,、二醫(yī)院，盧灣區(qū)中心醫(yī)院,，市醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)中心,，市兒童醫(yī)院，市精神衛(wèi)生中心等11所醫(yī)院舉行教學(xué)醫(yī)院掛牌儀式,。
1991年,，上海市編制委員會(huì)同意建立上海第二醫(yī)科大學(xué)附屬上海兒童醫(yī)學(xué)中心。中法合作建設(shè)的衛(wèi)生部上海第二醫(yī)科大學(xué)法語培訓(xùn)中心在學(xué)校揭牌,。經(jīng)國家人事部,、全國博士后管委會(huì)批準(zhǔn)，二醫(yī)大設(shè)立臨床醫(yī)學(xué)博士后流動(dòng)站,。同年,，上海市激光醫(yī)學(xué)研究所成立。
1992年,，二醫(yī)大開始招收外國博士研究生,。
1993年，國內(nèi)第一家人類基因治療研究中心,、二醫(yī)大生物力學(xué)研究室,、上海市人類基因組研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室相繼成立。上海市高教局醫(yī)學(xué)細(xì)胞生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室在二醫(yī)大掛牌,。同年,，上海市高級(jí)護(hù)理中心在瑞金醫(yī)院揭牌。
1994年,，二醫(yī)大臨床醫(yī)學(xué)教育研究中心成立,。國務(wù)院學(xué)位委員會(huì)批準(zhǔn)二醫(yī)大為自行審定博士導(dǎo)師的試點(diǎn)單位。
1996年,，二醫(yī)大成人教育學(xué)院成立,。上海市人民政府組織的專家評(píng)審委員會(huì)對(duì)本校申請(qǐng)進(jìn)入“211工程”進(jìn)行了部分預(yù)審，同意列入國家“211工程”建設(shè)項(xiàng)目。
1997年,，上海第二醫(yī)科大學(xué)同意將上海兒童醫(yī)學(xué)中心列為新華醫(yī)院分支機(jī)構(gòu),。
1998年，上海消化外科研究所,、上海人類基因組研究中心成立,。嘉定衛(wèi)校建制歸并上海二醫(yī)大衛(wèi)校。
1999年,，上海市小兒先天性心臟病研究所,、上海第二醫(yī)科大學(xué)小兒血液腫瘤研究中心及二醫(yī)大與中科院上海生命科學(xué)研究院共建的“上海生命科學(xué)研究院健康科學(xué)中心”相繼成立。瑞金醫(yī)院與盧灣區(qū)中心醫(yī)院,、上海市政醫(yī)院合作合并正式啟動(dòng),。
2000年，上海第二醫(yī)科大學(xué)全科醫(yī)學(xué)培訓(xùn)中心宣告成立舉行揭牌儀式,。這是上海市成立的第一家全科醫(yī)學(xué)培訓(xùn)中心,。上海第二醫(yī)科大學(xué)與上海交通大學(xué)聯(lián)合組建醫(yī)學(xué)內(nèi)植物工程聯(lián)合研究所。
2001年,，上海市精神衛(wèi)生院中心與二醫(yī)大實(shí)行強(qiáng)強(qiáng)聯(lián)合,，共建精神衛(wèi)生臨床醫(yī)學(xué)院。上海第二醫(yī)科大學(xué)發(fā)育生物學(xué)研究中心成立,。二醫(yī)護(hù)理專業(yè)由五年制改為四年制,。
2002年，中法生命科學(xué)和基因研究中心,、二醫(yī)大公共衛(wèi)生學(xué)院,、遠(yuǎn)程教育學(xué)院成立。由中科院上海生命科學(xué)研究院和二醫(yī)大聯(lián)合成立的“健康科學(xué)中心”舉行揭牌儀式,。
2003年,，二醫(yī)大護(hù)理學(xué)院及上海第二醫(yī)科大學(xué)微創(chuàng)外科中心成立。
2004年,，教育部公布首批國家精品課程,，二醫(yī)大王一飛教授領(lǐng)銜的“組織胚胎學(xué)”名列其中。二醫(yī)大研究生院,、二醫(yī)大“國藥人文與衛(wèi)生管理學(xué)院”成立,。中法共建的“中國科學(xué)院上海巴斯德研究所”、二醫(yī)大與蒙納士大學(xué)合作協(xié)議簽字暨中澳衛(wèi)生管理教育研究培訓(xùn)中心分別揭牌成立,。二醫(yī)大與芬蘭北中部綜合大學(xué)聯(lián)合創(chuàng)立的“中芬醫(yī)學(xué)教育中心”在芬蘭科科拉市揭牌,。
四、2005年—至今
上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院
2005年,，上海交通大學(xué)、上海第二醫(yī)科大學(xué)正式合并,。新的上海交通大學(xué)為教育部直屬高校,，在原上海第二醫(yī)科大學(xué)和原上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院基礎(chǔ)上,，組建上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院。教育部和上海市政府將合作共建上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院,。
同年,，醫(yī)學(xué)教育發(fā)展與研究中心、二醫(yī)大生命醫(yī)學(xué)倫理中心成立揭牌成立,。附屬寶鋼醫(yī)院改名為附屬第三人民醫(yī)院,。上海市教委批準(zhǔn)原上海第二醫(yī)科大學(xué)衛(wèi)生技術(shù)學(xué)院為獨(dú)立設(shè)置的全日制高等學(xué)院—上海衛(wèi)生職業(yè)技術(shù)學(xué)院，由上海市教委與上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院雙重領(lǐng)導(dǎo),。
6月,，醫(yī)學(xué)教育發(fā)展與研究中心對(duì)二醫(yī)大二級(jí)學(xué)院及相關(guān)部處開展自2003年教學(xué)評(píng)估以來首次教育教學(xué)整改驗(yàn)收工作，驗(yàn)收采取發(fā)展性教學(xué)評(píng)價(jià),，對(duì)學(xué)校各方面所采取的措施及成效等內(nèi)容進(jìn)行驗(yàn)收,。
2006年，醫(yī)學(xué)院“十五”,、“211工程”建設(shè)項(xiàng)目接受并通過專家組評(píng)審驗(yàn)收,。同年，上海交大醫(yī)學(xué)院數(shù)字醫(yī)學(xué)研究院成立,。上海交通大學(xué)人文與衛(wèi)生管理學(xué)院（上海交通大學(xué)國藥人文與衛(wèi)生管理學(xué)院）更名為上海交通大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院,。上海市精神衛(wèi)生中心、中國福利會(huì)國際和平婦幼保健院正式成為上海交大醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院,。本年度,，醫(yī)學(xué)院附屬第九人民醫(yī)院張志愿教授領(lǐng)銜的“口腔頜面外科學(xué)”課程，被列為國家精品課程,。
2007年,，醫(yī)學(xué)院婦產(chǎn)科學(xué)研究所、上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院上海干細(xì)胞研究所,、醫(yī)學(xué)院精神衛(wèi)生學(xué)系,、婦產(chǎn)科學(xué)系、兒科學(xué)系分別成立,。上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院蘇州九龍醫(yī)院開業(yè),。醫(yī)學(xué)院中法醫(yī)學(xué)部、上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)科學(xué)研究院分別舉行揭牌儀式,。
2008年,，上海國際造口治療師學(xué)校在醫(yī)學(xué)院附屬第九人民醫(yī)院揭牌成立。本年度首次在學(xué)生中嘗試國內(nèi)外聯(lián)合培養(yǎng)“MD+PhD”雙學(xué)位研究生,。醫(yī)學(xué)院新增口腔粘膜病學(xué),、醫(yī)學(xué)影像學(xué)為國家級(jí)精品課程。
