葡萄膜黑色素瘤(uveal melanoma, UM)是起源于眼球內(nèi)血管膜的惡性腫瘤,也是成人最常見的眼內(nèi)惡性腫瘤。UM惡性度高、易轉(zhuǎn)移,約一半的UM患者在疾病過程中發(fā)生肝轉(zhuǎn)移。UM患者一旦發(fā)生轉(zhuǎn)移,生存期很短,肝轉(zhuǎn)移患者中位無進(jìn)展生存期和總生存期僅為3.3個(gè)月和10.2個(gè)月。同時(shí),與皮膚和黏膜等其他部位黑色素瘤不同,UM對(duì)化療、放療和免疫治療等均不敏感,上述治療對(duì)提高生存率和生存期的作用極其有限。UM發(fā)病隱匿,早期不易發(fā)現(xiàn),加之對(duì)該病認(rèn)識(shí)不足,導(dǎo)致我國UM晚期患者比例高、病情重。因此,尋找UM有效治療靶點(diǎn),降低UM死亡率是亟待解決的臨床難題。

圖1:論文封面
近日,上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院范先群院士團(tuán)隊(duì)和精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)院執(zhí)行院長雷鳴教授團(tuán)隊(duì)聯(lián)合研究揭示了葡萄膜黑色素瘤糖異生關(guān)鍵酶別構(gòu)激活機(jī)制,也闡明了乙酰輔酶A如何別構(gòu)調(diào)控丙酸羧化酶的這一關(guān)鍵科學(xué)問題,研究結(jié)果以論著形式于近日發(fā)表于Cell子刊Molecular Cell。(圖1)

圖為范先群院士
上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第九人民醫(yī)院眼科的前期研究顯示,代謝重編程是UM惡性特征之一,腫瘤細(xì)胞通過無氧糖酵解、谷氨酰胺代謝、非主要供能物質(zhì)供能等代謝重編程,適應(yīng)缺氧的微環(huán)境,滿足自身快速增殖時(shí)的物質(zhì)和能量需求(Yu et al. Genome Biol,2021)。研究發(fā)現(xiàn),糖異生的異常激活與UM肝轉(zhuǎn)移密切相關(guān),是治療轉(zhuǎn)移性UM的理想靶點(diǎn)(Nat Rev Cancer. 2013)。同時(shí),丙酸羧化酶(pyruvate carboxylase, PC)是催化丙酮酸的羧化生成草酰乙酸的關(guān)鍵酶,也是糖異生的第一步限速步驟。這一過程中,乙酰輔酶A作為重要的別構(gòu)激活代謝物,參與該反應(yīng)的過程。然而,乙酰輔酶A介導(dǎo)的丙酮酸羧化酶別構(gòu)調(diào)控機(jī)制在UM的發(fā)病中的作用尚不清楚。

圖為雷鳴教授開展科研實(shí)驗(yàn)
針對(duì)該關(guān)鍵科學(xué)問題,上海九院眼科柴佩韋博士和上海精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究院蘭鵬飛研究員等在范先群院士和雷鳴教授指導(dǎo)下,在丙酸羧化酶中特異引入了四個(gè)點(diǎn)突變,破壞乙酰輔酶A和丙酸羧化酶的作用位點(diǎn),促進(jìn)丙酸羧化酶自我激活。團(tuán)隊(duì)研究發(fā)現(xiàn),在葡萄膜黑色素瘤細(xì)胞中,自我激活丙酸羧化酶的表達(dá)顯著抑制細(xì)胞生長和克隆形成;自我激活的丙酸羧化酶的過度表達(dá)導(dǎo)致線粒體中草酰乙酸的顯著增加和乙酰輔酶A的含量減少。這一結(jié)果表明,自我激活的丙酸羧化酶活性的提高消耗了更多的丙酮酸來生產(chǎn)草酰乙酸,因此丙酮酸脫氫酶可以將較少的丙酮酸轉(zhuǎn)化為乙酰輔酶A。伴隨著乙酰輔酶A的減少,研究人員還觀察到表達(dá)自我激活的丙酸羧化酶的細(xì)胞中檸檬酸鹽水平降低,這與線粒體中大多數(shù)乙酰輔酶A被消耗用于檸檬酸鹽合成的事實(shí)一致。上述結(jié)果表明,對(duì)乙酰輔酶A調(diào)節(jié)敏感的功能性丙酸羧化酶對(duì)于葡萄膜黑色素瘤等細(xì)胞的代謝穩(wěn)態(tài)和氧化呼吸至關(guān)重要。(圖2)

圖2
那么,乙酰輔酶A如何誘導(dǎo)丙酸羧化酶復(fù)合物中的生物素羧化穩(wěn)定呢?研究人員捕獲了一系列乙酰輔酶A/丙酸羧化酶復(fù)合物的結(jié)構(gòu),分別純化了生物素羧化(BC)結(jié)構(gòu)域和羧基轉(zhuǎn)位(CT)結(jié)構(gòu)域。對(duì)這些結(jié)構(gòu)的比較分析表明,生物素羧化結(jié)構(gòu)域的穩(wěn)定性與乙酰輔酶A結(jié)合之間存在顯著的相關(guān)性。進(jìn)一步的冷凍電鏡分析表明,乙酰輔酶A誘導(dǎo)復(fù)合物中生物素羧化結(jié)構(gòu)域的穩(wěn)定,從而形成與天然丙酸羧化酶復(fù)合物難以區(qū)分的構(gòu)象。綜上所述,該研究結(jié)果表明,乙酰輔酶A在生物素羧化的穩(wěn)定結(jié)合中起著中介作用,并有助于形成生物素羧化和PT-CT-BCCP更穩(wěn)定的結(jié)構(gòu)(圖3),乙酰輔酶A在丙酸羧化酶催化轉(zhuǎn)化過程中降低了活化熵并誘導(dǎo)了更有序的熱力學(xué)構(gòu)型,這是以前的晶體結(jié)構(gòu)研究無法解釋的。

圖3:Acetyl-CoA介導(dǎo)BC和PT-CT-BCCP形成更穩(wěn)定的結(jié)構(gòu)
由于丙酸羧化酶是重要的代謝調(diào)控酶,在胰島素分泌、脂肪生成和神經(jīng)遞質(zhì)生物合成中起著至關(guān)重要的作用,也是肥胖、糖尿病、病毒感染和癌癥的重要靶點(diǎn)。鑒于丙酸羧化酶的變構(gòu)效應(yīng)在多種疾病的代謝重編程中起著重要作用,丙酸羧化酶與乙酰輔酶A復(fù)合物的結(jié)構(gòu)信息在肥胖癥、糖尿病、病毒感染和惡性腫瘤的藥物研發(fā)擁有重要治療意義。
團(tuán)隊(duì)負(fù)責(zé)人介紹
范先群教授,中國工程院院士,長江學(xué)者特聘教授,眼科學(xué)專家,上海交通大學(xué)講席教授。現(xiàn)任上海交通大學(xué)副校長、上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院院長、中國醫(yī)院發(fā)展研究院院長,上海市眼眶病眼腫瘤重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室主任,上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第九人民醫(yī)院眼科學(xué)科帶頭人。兼任亞太眼腫瘤眼病理學(xué)會(huì)主席,亞太眼整形外科學(xué)會(huì)第五屆主席,國際眼科科學(xué)院院士、英國皇家眼科學(xué)院院士和愛丁堡皇家外科學(xué)院榮譽(yù)院士。榮獲兩項(xiàng)國家科技進(jìn)步二等獎(jiǎng)(第一完成人),何梁何利科技進(jìn)步獎(jiǎng),亞太眼科科學(xué)院首屆創(chuàng)新者大獎(jiǎng)、亞太眼科最高學(xué)術(shù)成就獎(jiǎng)De Ocampo Lecture獎(jiǎng)。
雷鳴,研究員,博士生導(dǎo)師,上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究院執(zhí)行院長。長期致力于生物大分子結(jié)構(gòu)和分子機(jī)理及其在癌癥和衰老中的作用等科研工作,在Cell、Nature、Science等國際頂級(jí)學(xué)術(shù)期刊上發(fā)表論文60余篇。