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科學(xué)研究
腫瘤化學(xué)生物學(xué)研究組
  作者:黃婉瑩  2018-12-30

 研究組長介紹 >>>

         

   

張良,,博士,研究員,,博士生導(dǎo)師,,腫瘤化學(xué)生物學(xué)課題組組長,,國家優(yōu)秀青年科學(xué)基金獲得者,,上海市曙光學(xué)者,上海交通大學(xué)唐立新優(yōu)秀學(xué)者獎獲得者,,上海交通大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院杰出員工,。團隊主要致力于腫瘤相關(guān)分子調(diào)控機制研究和先導(dǎo)藥物發(fā)現(xiàn)。通過綜合運用化學(xué)生物學(xué),、結(jié)構(gòu)生物學(xué),、細胞生物學(xué)、代謝組學(xué)和藥學(xué)等技術(shù)手段,,闡明人體細胞中核酸表觀遺傳調(diào)控(DNA/RNA甲基化-去甲基化),、脂肪酸和核苷酸在細胞內(nèi)合成過程中關(guān)鍵酶的分子機制,明確其在腫瘤發(fā)生發(fā)展過程中的作用和調(diào)控機制,,并建立高通量實體藥物篩選體系,,篩選靶向性抗腫瘤先導(dǎo)藥物。近年來以通訊作者在化學(xué)生物學(xué)國際旗艦學(xué)術(shù)刊物(Nature Chemical Biology,、Nature Communications,、Cell Research、Chemical Science,、PNAS,、Elife等)上發(fā)表一系列SCI論文,獲得并轉(zhuǎn)化多項國際/美國/國內(nèi)技術(shù)發(fā)明專利,。

研究方向與進展 >>>

 

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    地球上所有生命都由核酸和脂肪酸組成,。核酸是遺傳信息載體(DNA和RNA),脂肪酸是細胞膜主要成分,。因此,,細胞需耗費大量能源來確保核酸和脂肪酸的穩(wěn)定合成,并建立一整套監(jiān)管機制來對整個過程進行監(jiān)督和動態(tài)調(diào)控,。相對于正常細胞,,腫瘤具有瘋狂生長和廣泛轉(zhuǎn)移的致命特征。腫瘤如何通過改變正常的核酸和脂肪酸修飾調(diào)控方式來實現(xiàn)其特征,?這是我們試圖探究的問題,。

   研究內(nèi)容-1:核酸表觀遺傳修飾通路關(guān)鍵酶的分子調(diào)控機制研究新藥發(fā)現(xiàn)。細胞通過對DNA或RNA上特定堿基的修飾,,來動態(tài)調(diào)控基因表達和蛋白翻譯,,實現(xiàn)不同生物功能。這一調(diào)控跟腫瘤發(fā)生發(fā)展至關(guān)重要,。我們主要研究DNA和RNA去甲基化酶的分子機制和在腫瘤中的生物功能,,闡明它們識別核酸修飾的分子機制,并篩選靶向去甲基化酶的新型抗腫瘤藥物,。

   研究內(nèi)容-2:核酸生物合成與代謝通路關(guān)鍵酶的分子機制研究新藥發(fā)現(xiàn),。核苷酸的生物合成是細胞主要生命活動之一,,受嚴格的監(jiān)管和調(diào)控。而腫瘤細胞則需突破這些監(jiān)管來實現(xiàn)核苷酸的大量合成,。我們主要鑒定和發(fā)現(xiàn)在腫瘤突破監(jiān)管的過程中的關(guān)鍵酶,,研究并闡明其在腫瘤中的獨特分子機制,篩選靶向這些關(guān)鍵酶的新型抗腫瘤藥物,。

    研究內(nèi)容-3:脂肪酸生物合成與代謝通路關(guān)鍵酶的分子機制研究新藥發(fā)現(xiàn),。脂肪酸的生物合成也是細胞主要生命活動之一。其通過一系列酶催化底物蛋白上的脂肪酸修飾來實現(xiàn)脂肪酸的生物合成,。我們主要研究這一系列酶動態(tài)識別和催化調(diào)控底物蛋白的分子機制,并篩選靶向該途徑酶系的新型抗腫瘤藥物,。

科研項目 >>>

1. 國家自然科學(xué)基金委面上項目,,2021/012024/1263萬元,,主持,;

2. 國家自然科學(xué)基金委重大研究計劃(培育),2019/012021/12,,60萬元,,主持;

3. 國家自然科學(xué)基金委優(yōu)秀青年科學(xué)基金項目,,2018/012020/12,,130萬元,主持,;

4. 國家自然科學(xué)基金委面上項目,,2016/012019/1265萬元,,主持,;

5. 上海市2022年度“科技創(chuàng)新行動計劃”生物醫(yī)藥科技支撐專項項目,2022/04~2025/03,,20萬元,,主持;

6. 上海市2022年度“科技創(chuàng)新行動計劃”生物醫(yī)藥科技支撐專項項目,,2020/09~2023/09,,20萬元,主持,;

7. 上海市“曙光計劃”項目,,2021/01~2024/12,15萬元,,主持,;

8.上海交通大學(xué)海外人才引進項目,,2015/01~2019/12,200萬,,主持,;

9. 985新藥平臺隊伍配套,2015/03~2018/12,,30萬,,主持;

代表性論文,、專著與專利 >>>

1. Y.J. Mu#, L. Zhang#, *, J.Y. Hu#, J.S. Zhou, H.W. Lin, C. He, H.Z. Chen*, and L. Zhang*. A fungal dioxygenase CcTet serves as a eukaryotic 6mA demethylase on duplex DNA. Nat. Chem. Biol., 2022, 18, 733.

2. R.Y. Shang, J. Cui, J.X. Li, X.X. Miao, L. Zhang, D.D. Xie, L. Zhang, H.W. Lin, W.H. Jiao. Nigerin and ochracenes J?L, new sesquiterpenoids from the marine sponge symbiotic fungus Aspergillus niger. Tetrahedron, 2022, 104, 132599.

3. P. Zhang#, L. Zhang#, *, Z.Y. Hou, H.W. Lin, H. Gao*, and L. Zhang*. Structural basis for the substrate recognition mechanism of ATP-sulfurylase domain of human PAPS synthase 2. Biochem. Biophys. Res. Commun., 2021, 586, 1.

4. J.S. Zhou#, L. Zhang#, L.P. Zeng#, L. Yu#, Y.Y. Duan#, S.Q. Shen#, J.Y. Hu, P. Zhang, W.Y. Song, X.X. Ruan, J. Jiang, Y.N. Zhang, L. Zhou, J. Jia, X.D. Hang, C.L Tian, H.Z. Chen*, J.E. Cronan*, H.K. Bi*, L. Zhang*. Helicobacter pylori FabX contains a [4Fe-4S] cluster essential for unsaturated fatty acid synthesis. Nat. Commun., 2021, 12, 6932.

5. G.K. Chen#, J.S. Zhou#, Y.L. Zuo, W.P. Huo, J. Peng, M. Li, Y.N. Zhang, T.T. Wang, L. Zhang, L. Zhang*, H.H. Liang*. Structural basis for diguanylate cyclase activation by its binding partner in Pseudomonas aeruginosa. Elife. 2021, 10, e67289.

6. S.H. Xiao#, S.Q. Guo, J. Han, Y.L. Sun, M.C. Wang, Y.T. Chen, X.Y. Fang, F. Yang, Y.J. Mu, L. Zhang, Y.L. Ding, N.X. Zhang, H.L. Jiang, K.X. Chen, K.H. Zhao, C. Luo, S.J. Chen*. High-Throughput-Methyl-Reading (HTMR) assay: a solution based on nucleotide methyl-binding proteins enables large-scale screening for DNA/RNA methyltransferases and demethylases. Nucleic Acids Res., 2021, 50, e9.

7. J.S. Zhou, L. Zhang, L. Zhang*. Advances on Mechanism and Drug Discovery of Type-II Fatty Acid Biosynthesis Pathway. Acta Chimica Sinia, 2020, 78, 1383.

8. T. R. Fu#, L. P. Liu#, Q. L. Yang#, Y. X. Wang, P. Xu, L. Zhang, S. E. Liu, Q. Dai, Q. J. Ji, G. L. Xu, C. He, C. Luo* and L. Zhang*. Thymine DNA glycosylase recognizes the geometry alteration of minor grooves induced by 5-formylcytosine and 5-carboxylcytosine. Chem. Sci. 2019, 10, 7407.

9. S. Q. Shen#, X. D Hang#, J. J. Zhuang#, L. Zhang*, H. K. Bi* and L. Zhang*. A back-door Phenylalanine coordinates the stepwise hexameric loading of acyl carrier protein by the fatty acid biosynthesis enzyme β-hydroxyacyl-acyl carrier protein dehydratase (FabZ). Int. J. Biol. Macromol. 2019, 128, 5.

10. X. Zhang#, L. H. Wei#, Y. X. Wang#, Y. Xiao#, J. Liu, W. Zhang, N. Yan, G. B. Amu, X. J. Tang, L. Zhang* and G. F. Jia*. Structural insights into FTO's catalytic mechanism for the demethylation of multiple RNA substrates. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2019, 116, 2919.

11. L. Zhang, J. F. Xiao, J. R. Xu, T. R. Fu, Z. W. Cao, L. Zhu, H. Z. Chen, X. Shen, H. L. Jiang and L. Zhang*. Crystal structure of FabZ-ACP complex reveals a dynamic seesaw-like catalytic mechanism of dehydratase in fatty acid biosynthesis. Cell Res. 2016, 26, 1330.

12. L. Zhang#, W. Z. Chen#, L. M. Iyer, J. Hu, G. Wang, Y. Fu, M. Yu, Q. Dai, L. Aravind and C. He. A TET homologue protein from Coprinopsis cinerea (CcTET) that biochemically converts 5-Methylcytosine to 5-Hydroxymethylcytosine, 5-Formylcytosine, and 5-Carboxylcytosine. J. Am. Chem. Soc. 2014, 136, 4801.

13. L. Zhang#, K. E. Szulwach#, G. C. Hon#, C. X. Song, B. Park, M. Yu, X. Y. Lu, Q. Dai, X. Wang, C. R. Street, H. P. Tan, J. H. Min, B. Ren, P. Jin, C. He. Tet-mediated covalent labelling of 5-methylcytosine for its genome-wide detection and sequencing. Nat. Commun. 2013, 4, 1517.

14. L. Zhang, X. Y. Lu, J. Y. Lu, H. H. Liang, Q. Dai, G. L. Xu, C. Luo, H. L. Jiang, C. He. Thymine DNA glycosylase specifically recognizes 5-carboxylcytosine-modified DNA. Nat. Chem. Biol. 2012, 8, 328.

15. C. He, L. Zhang, C. X. Song, M. Yu. Composition and Methods Related to Modification of 5-methylcytosine (5mC). 2012, Publication number: WO WO2012138973 A3 (PCT專利).

16. K. Jonas, C. He, T. A. Clark, L. Zhang, X. Y. Lu. Identification of 5-methyl-c in nucleic acid templates. 2013, Publication number: WO2013163207 A1 (PCT專利).


團隊介紹 >>>

腫瘤化學(xué)生物學(xué)研究團隊由張良研究員于2014年建立,。團隊主要從事癌癥相關(guān)的核酸與脂肪酸修飾調(diào)控分子機制研究和新藥發(fā)現(xiàn)工作。通過綜合運用化學(xué)生物學(xué),、結(jié)構(gòu)生物學(xué),、細胞生物學(xué)、代謝組學(xué)和藥學(xué)等技術(shù)手段,,尋找腫瘤在核酸表觀遺傳修飾調(diào)控,、核酸合成與代謝、及脂肪酸合成與代謝途徑中的新靶標,,闡明其分子作用新機制,、篩選靶向該靶標的抗腫瘤新藥物。研究團隊先后獲得了國家重點研發(fā)計劃(培育),、國家自然科學(xué)優(yōu)秀青年基金和面上項目,、上海市高層次人才項目和曙光計劃等項目的資助,具有從事開展相關(guān)研究的優(yōu)異科研條件,。團隊培養(yǎng)的學(xué)生獲得了上海市優(yōu)秀畢業(yè)生,、國家獎學(xué)金、瑞沃德基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)明德獎學(xué)金,、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院一等獎學(xué)金等在內(nèi)的多項獎學(xué)金,。目前研究團隊在Nature Chemical Biology, Nature Communications, Cell Research, Chemical Science, JACS, PNAS等國際著名期刊已發(fā)表論文多篇,獲得并轉(zhuǎn)化了國際/國內(nèi)專利多項,。