研究組長介紹
李華兵
電話: +86-18621822668 021-63846590-776794
郵箱：[email protected]
個人簡歷
2020.5-至今 癌基因與相關(guān)基因國家重點實驗室 研究組長（PI）,；上海交通大學醫(yī)學院附屬仁濟醫(yī)院 兼職教授
2019.5-至今 上海交通大學醫(yī)學院-耶魯大學免疫代謝研究院 研究員（PI）
2017.8-至今 上海交通大學醫(yī)學院 上海市免疫學研究所 研究員(PI),，博士生導(dǎo)師
2012-2017 美國耶魯大學 博士后 導(dǎo)師：Richard A. Flavell
2011-2012 美國新澤西州立大學 博士后 導(dǎo)師：Vincenzo Pirrotta
2005-2011 美國新澤西州立大學 博士（Ph.D.） 導(dǎo)師：Vincenzo Pirrotta
2002-2005 南開大學 碩士（M.S.） 導(dǎo)師：宋文芹
1999-2002 南開大學 理學學士 (B.S.),；耶魯大學醫(yī)學院免疫生物學系 客座助理教授(Assistant Professor Adjunct)
李華兵博士于南開大學本科(1999-2002)和碩士(2002-2005)畢業(yè)后,，先后在國外知名頂尖實驗室接受嚴格的系統(tǒng)科學訓(xùn)練,， 在新澤西州立大學完成博士學位研究（2005-2011, 博士生導(dǎo)師：Vincenzo Pirrotta, Rutgers University,，國際知名表觀遺傳學家）,， 在耶魯大學完成博士后研究（2012-2017,， 博士后導(dǎo)師：Richard Flavell, Yale University,，國際著名免疫學家/美國國家科學院等三院院士）。2017年8月正式入職上海交通大學醫(yī)學院上海市免疫學研究所,，建立RNA代謝與免疫疾病課題組,，并積極參入?yún)f(xié)助交大醫(yī)學院、耶魯,、Richard Flavell院士和蘇冰教授建立上海交通大學醫(yī)學院-耶魯大學聯(lián)合免疫代謝研究院(Shanghai JiaoTong University School of Medicine – Yale University Institute for Immune Metabolism, SYIIM),。
在RNA表觀遺傳學和T 細胞免疫生物學交叉領(lǐng)域，李華兵研究員作為第一/共同第一作者,、通訊/共同通訊作者已在Nature, Science,，Cell Research，Immunity等國際一流期刊發(fā)表研究論文20 余篇,。李華兵課題組主要從事免疫細胞中的RNA代謝的研究,，以基因編輯小鼠的免疫疾病模型為基礎(chǔ)，集中關(guān)注在機體免疫反應(yīng)中RNA層面的表觀修飾過程以及RNA結(jié)合蛋白的生理和分子生物學功能,，通過前沿的高通量篩選測序和反向遺傳學方法,，鑒定出調(diào)控免疫反應(yīng)的重要分子靶標，為開發(fā)腸道炎癥,、肝炎等自身免疫疾病以及相關(guān)腫瘤的治療藥物提供新策略新方法,。
研究方向
目前已知RNA含有100余種化學修飾，其中m6A, m1A, m5C, pseudoUridine, APA是RNA上最主要的幾種化學修飾,。課題組團隊在m6A領(lǐng)域已經(jīng)做出了系列原創(chuàng)性研究,，積累了扎實的學術(shù)基礎(chǔ)和構(gòu)建了堅實的實驗平臺。目前m6A的研究已經(jīng)成為了一個熱點領(lǐng)域,，但是大家對于其它類型的RNA修飾關(guān)注不是很多,，特別是不同的RNA修飾之間如何協(xié)調(diào)應(yīng)對外界不同類型的刺激從而協(xié)同調(diào)控RNA的水平和功能鮮有研究。我們目前的初步研究成果表明各種不同的RNA修飾在T細胞激活的過程中發(fā)揮著關(guān)鍵的主動的作用,，而且這些修飾之間存在著功能上的相互作用和協(xié)調(diào),。
在接下來的研究中將在以下幾個方面開展工作：
（1）m1A RNA 表觀遺傳修飾對于其他免疫細胞功能的影響以及對腫瘤的治療作用；
（2）pseudoUridine在免疫細胞中的功能以及其作用的分子機制,；
（3）APA在免疫細胞中的功能以及其作用的分子機制,；
（4）其它RNA結(jié)合蛋白在免疫細胞中的功能和分子機制,；
（5）不同RNA修飾類型之間的協(xié)同作用及其規(guī)律。
科研項目
在研項目
1.上海交通大學醫(yī)學院科研啟動支持,， 2017-2023,，300萬元，在研,，主持
2.國家自然科學基金“生物大分子動態(tài)修飾與化學干預(yù)重大研究計劃” 重大研究計劃培育項目,，91753141 ，“m6A RNA甲基化修飾動態(tài)變化對CD8 T細胞功能調(diào)控的研究”,，2018/01-2020/12,，70萬元，在研,，主持
3.中組部海外高層次青年人才計劃,，“免疫T細胞中RNA修飾的功能研究”，2018-2021,，300萬,，在研，主持
4.上海市科委動物模型專項,，2020-2021,，20萬，在研,，主持
5.上海市科技創(chuàng)新行動計劃,，2021-2023，80萬,，在研,，主持
6.國家自然科學基金醫(yī)學部重點項目，2021-2025,，297萬,，主持
7.國家自然科學基金生命學部面上項目，2021-2024,，57萬,，主持
論文與專著
1. Li HB, Muller M, Bahechar I, Kyrchanova O, Ohno K, Georgiev P, and Pirrotta V. (2011) Insulators, not Polycomb Response Elements, are required for long-range interactions between Polycomb targets in Drosophila. Mol. Cell. Biol. 31(4):616-25. doi: 10.1128/MCB.00849-10. PMID: 21135119
2. Pirrotta V., and Li HB (2012). A view of nuclear Polycomb bodies. Curr. Opin. Genet. Dev. 22(2):101-9. doi: 10.1016/j.gde.2011.11.004. PMID: 22178420
3. Schwartz YB, Linder-Basso D, Kharchenko PV, Tolstorukov MY, Kim M, Li HB, Gorchakov AA, Minoda A, Shanower G, Alekseyenko AA, Riddle NC, Jung YL, Gu T, Plachetka A, Elgin SC, Kuroda MI, Park PJ, Savitsky M, Karpen GH, Pirrotta V. (2012) Nature and function of insulator protein binding sites in the Drosophila genome. Genome Res. 22(11): 2188-98. doi: 10.1101/gr.138156.112. PMID: 22767387
4. Li HB, Ohno K, Gui H, and Pirrotta V. (2013) Insulators target active genes to transcription factories and Polycomb-repressed genes to PcG bodies. PLoS Genet. 9(4):e1003436. doi: 10.1371/journal.pgen.1003436. PMID: 23637616 (Highlighted by Cell: 153(5), p935)
5. Li HB#, Jin C#, Chen Y#, Flavell RA. (2014) Inflammasome activation and metabolic disease progression. Cytokine Growth Factor Rev. 25(6):699-706. doi: 10.1016/j.cytogfr.2014.07.020. PMID: 25156419 (# equal contribution)
6. Zhu S#, Li HB#, Flavell RA. (2014) Resemble and Inhibit: When RLR Meets TGF-β. Mol Cell. 56(6):719-20. doi: 10.1016/j.molcel.2014.12.010. PMID: 25526529 (# equal contribution)
7. Cao G#, Li HB#, Yin Z, Flavell RA. (2016) Recent advances in dynamic m6A RNA modification. Open Biology. 6(4): 160003. doi: 10.1098/rsob.160003. PMID: 27249342 (# equal contribution)
8. Li HB. (2016) Chromosome Conformation Capture in Drosophila. Methods Mol. Biol. 1480:207-12. doi: 10.1007/978-1-4939-6380-5_18. PMID: 27659987
9. Hu B#, Jin C#, Li HB#, Tong J, Ouyang X, Cetinbas NM, Zhu S, Strowig T, Lam FC, Zhao C, Henao-Mejia J, Yilmaz O, Fitzgerald KA, Eisenbarth SC, Elinav E, Flavell RA. (2016) The DNA Sensing Aim2 Inflammasome Controls Radiation Induced Cell death and Tissue Injury. Science, 354 (6313): 765-768. DOI: 10.1126/science.aaf7532. PMID: 27846608 (# equal contribution)
10. Zhu S, Ding S, Wang P, Wei Z, Pan W, Palm NW, Yang Y, Yu H, Li HB, Wang G, Lei X, de Zoete MR, Zhao J, Zheng Y, Chen H, Zhao Y, Jurado KA, Feng N, Shan L, Kluger Y, Lu J, Abraham C, Fikrig E, Greenberg HB, Flavell RA. (2017) Nlrp9b inflammasome recognizes and restricts rotavirus infection in intestinal epithelial cells. Nature, 546(7660): 667-670. doi: 10.1038/nature22967. PMID: 28636595
11. Li HB#*, Tong J#, Zhu S#, Batista PJ, Duffy EE, Zhao J, Bailis W, Cao G, Kroehling L, Chen Y, Wang G, Broughton JP, Chen YG, Kluger Y, Simon MD, Chang HY, Yin Z*, Flavell RA*. (2017) m6A mRNA methylation controls T cell homeostasis by targeting IL-7/STAT5/SOCS pathway. Nature. 2017 Aug 17;548(7667):338-342. doi: 10.1038/nature23450. Epub 2017 Aug 9.. PMID: 28792938 (# equal contribution, * co-corresponding)
12. Tong J#, Cao G#, Zhang T#, Sefik E, Vesely M, Broughton J, Zhu S, Li H, Li B, Chen L, Chang HY, Su B, Flavell RA*, Li HB*. (2018) m6A mRNA methylation sustains Treg suppressive functions. Cell Research, 28(2): 253-256. doi:10.1038/cr.2018.7. PMID: 29303144 (*co-corresponding)
13. Yu X, Lao Y, Teng XL, Li S, Zhou Y, Wang F, Guo X, Deng S, Chang Y, Wu X, Liu Z, Chen L, Lu LM, Cheng J, Li B, Su B, Jiang J, Li HB*, Huang C*, Yi J* , Zou Q*. (2018) SENP3 maintains the stability and function of regulatory T cells via BACH2 deSUMOylation. Nature Communications. 2018 Aug 8;9(1):3157. doi: 10.1038/s41467-018-05676-6. PMID: 30089837 (* co-corresponding)
14. Tong J, Flavell RA*, Li HB*. (2018) RNA m6A modification and its functions in diseases. Frontiers of Medicine, 2018 Aug;12(4):481-489. doi: 10.1007/s11684-018-0654-8. PMID: 30097961 (* co-corresponding)
15. Yu X, Teng XL, Wang F, Zheng Y, Qu G, Zhou Y, Hu Z, Wu Z, Chang Y, Chen L, Li HB, Su B, Lu L, Liu Z, Sun SC, Zou Q. (2018) Metabolic control of regulatory T cell stability and function by TRAF3IP3 at the lysosome. J Exp Med. 2018 Sep 3;215(9):2463-2476. doi: 10.1084/jem.20180397. PMID: 30115741
16. Liu Y, Li HB*, Flavell RA*. (2018) cGAS activation in phased droplets. Cell Research, (2018) 0:1-2; doi: 10.1038/s41422-018-0087-6. PMID: 30218060 (* co-corresponding)
17. Wang J, Flavell RA*, Li HB*. (2019) Antiviral immunity: a link to bile acids. Cell Research, 2019 Mar;29(3):177-178. doi: 10.1038/s41422-019-0148-5. PMID: 30778178 (* co-corresponding)
18. Zhang X, Flavell RA*, Li HB*. (2019) hnRNPA2B1: a nuclear DNA sensor in antiviral immunity. Cell Research. 2019 Aug 30. doi: 10.1038/s41422-019-0226-8.
19. Hwang SS, Lim J, Yu Z, Kong P, Sefik E, Xu H, Harman CCD, Kim LK, Lee GR, Li HB, Flavell RA. (2020) mRNA destabilization by BTG1 and BTG2 maintains T cell quiescence. Science. 2020 Mar 13;367(6483):1255-1260. doi: 10.1126/science.aax0194. PMID: 32165587
20. Gao Y*#, Vasic R#, Song Y#, Teng R, Gbyli R, Biancon G, Nelakanti R, Liu C, Kudo E, Lobben K, Liu W, Ardasheva A, Fu X, Wang X, Joshi P, Lee V, Dura B, Viero G, Iwasaki A, Fan R, Xiao A, Flavell RA*, Li HB*, Tebaldi T*, Halene S*. (2020) Activation of Double-Stranded RNA Innate Immune Response and Hematopoietic Failure upon Loss of METTL3-Mediated m6A RNA Modification. Immunity. 2020 Jun 16;52(6):1007-1021.e8. doi: 10.1016/j.immuni.2020.05.003. Epub 2020 Jun 3. PMID: 32497523 (* co-corresponding)
21. Xu C*, Li HB*, Flavell RA*. A special collection of reviews on frontiers in immunology. Cell Research. 2020 Aug 28. doi: 10.1038/s41422-020-00403-7. (* co-corresponding)
團隊介紹
實驗室于2017年8月啟動。截至2020年12月在實驗室成員有1名助理研究員,、4名技術(shù)員,、5名博士后、4名博士生和2名碩士研究生,。
郝亞娟 博士,，助理研究員
毛凱瓊 碩士，技術(shù)員
楊 媚 碩士,，技術(shù)員
胡 昇 碩士,，技術(shù)員
周亞韜 碩士,，技術(shù)員
章 婷 博士,，余?博士后
周 靜 博士,，上海市超級博士后（博新計劃支持）
張興利 博士，上海市超級博士后
王雪飛 博士,，上海市超級博士后
李靖宇 博士,，上海市超級博士后
巢怡農(nóng) 2017級直博博士生
陳柏文 2018級博士生
繆珊 2019級直博博士生
陳韻竹 2020級直博博士生
陳慧芳 2018級碩士研究生
周艾煒 2020級碩士研究生
