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日前，生物信息學(xué)領(lǐng)域權(quán)威學(xué)術(shù)期刊Bioinformatic在線發(fā)表了細(xì)胞分化與凋亡重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室張健研究員課題組的最新研究成果“Allosite: a method for predicting allosteric sites”,。該項(xiàng)研究針對(duì)目前別構(gòu)蛋白位點(diǎn)難以識(shí)別這一技術(shù)瓶頸，發(fā)展生物信息學(xué)和藥物設(shè)計(jì)結(jié)合技術(shù)精確識(shí)別蛋白中別構(gòu)位點(diǎn)位置,，為今后高效選擇性的別構(gòu)藥物靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)及別構(gòu)藥物開(kāi)發(fā)提供了關(guān)鍵方法和設(shè)計(jì)方案,，具有重要的學(xué)術(shù)意義及應(yīng)用價(jià)值。
別構(gòu)效應(yīng)是指利用調(diào)節(jié)物（配體或其它分子）結(jié)合在蛋白質(zhì)活性位點(diǎn)以外的位點(diǎn)（別構(gòu)位點(diǎn)）所產(chǎn)生的一種直接,、快速,、有效的蛋白質(zhì)功能、結(jié)構(gòu)或適應(yīng)性的調(diào)節(jié)方式,，參與細(xì)胞代謝,，信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)等重要生命過(guò)程。與活性位點(diǎn)在進(jìn)化上為了適應(yīng)內(nèi)源性配體有較高同源性不同,，別構(gòu)位點(diǎn)具有高度多樣性,，結(jié)合別構(gòu)調(diào)節(jié)小分子的選擇性高，適于對(duì)蛋白家族中亞型成員進(jìn)行區(qū)且它的調(diào)節(jié)有一定的上限,，毒副作用更小,，是當(dāng)前藥物開(kāi)發(fā)領(lǐng)域的全新方向。
張健課題組利用前期工作中發(fā)現(xiàn)的別構(gòu)分子研究規(guī)律(Nucleic Acids Res. 2011, 39, 663-669),，系統(tǒng)分析別構(gòu)蛋白位點(diǎn)特征,，挖掘別構(gòu)位點(diǎn)空間三維結(jié)構(gòu)的出現(xiàn)規(guī)律，建立了基于統(tǒng)計(jì)學(xué)習(xí)理論的蛋白別構(gòu)位點(diǎn)預(yù)測(cè)的新方法,。該工具對(duì)蛋白別構(gòu)位點(diǎn)有很高的識(shí)別成功率,，在Metacaspase,，6-磷酸果糖激酶等多個(gè)蛋白上發(fā)現(xiàn)其別構(gòu)位點(diǎn)，為針對(duì)別構(gòu)位點(diǎn)的新型藥物開(kāi)發(fā)提供有力的幫助,。
第一作者黃文亢系張健研究員碩士研究生,，該項(xiàng)研究工作得到教育部新世紀(jì)優(yōu)秀人才、國(guó)家自然科學(xué)基金,、上海市浦江人才等基金支持,。
