上海交通大學醫(yī)學院（原上海第二醫(yī)科大學）醫(yī)學檢驗系始建于1983年,。當時,，為適應我國改革開放形勢對醫(yī)療衛(wèi)生事業(yè)發(fā)展和對醫(yī)學檢驗專業(yè)人才的需求，整合基礎醫(yī)學院及附屬瑞金醫(yī)院,、仁濟醫(yī)院,、新華醫(yī)院四方力量成立了醫(yī)學檢驗系,，使上海第二醫(yī)科大學（現(xiàn)上海交通大學醫(yī)學院）成為在國內首批創(chuàng)辦本科醫(yī)學檢驗教育的高等醫(yī)學院校之一。
1986年獲“臨床檢驗診斷學”碩士學位授予點,；
1986年與上海市臨床檢驗中心,、上海市醫(yī)學會合辦《上海醫(yī)學檢驗雜志》（現(xiàn)為《檢驗醫(yī)學》）；
1995年成立了上海市醫(yī)學檢驗重點實驗室,；
1998年獲“臨床檢驗診斷學”博士學位授予點,；
1999年-2001年醫(yī)學檢驗本科生實行專業(yè)分流和了解市場到“復星”、“科華”,、“血液中心”實習3個月,；
1999年-2002年為中華醫(yī)學會醫(yī)學檢驗教育分會、全國高等醫(yī)學教育學會醫(yī)學檢驗教育分會理事長和全國高等醫(yī)學院校醫(yī)學檢驗專業(yè)校際會議理事長單位,；
2003年根據(jù)教育部1998年頒發(fā)的醫(yī)學檢驗教育培養(yǎng)目標,、人才市場需求的變化,，經過反復醞釀，專家論證,，經上海市教委審批通過,，我系醫(yī)學檢驗專業(yè)學制由五年改為四年，并面向全國招收學生,；
2007年獲教育部一類學科“特色專業(yè)”,；
2007年至今，任教育部高等學校醫(yī)學技術類教學指導委員會主任委員單位,；
2008年起與瑞典卡爾斯塔德大學生命科學與技術系建立教學交流項目,，開創(chuàng)了本科生與國外學生交流互換（每年2-3名）進行系統(tǒng)的畢業(yè)論文訓練或臨床實習的機制和每年選派 1-2名青年教師進行互訪及教學交流；
2009年在全國醫(yī)學檢驗專業(yè)課程中率先實施“以問題為導向（PBL）”的教學,，并覆蓋了主干專業(yè)課程,；同年，實驗技術中心成為上海市和國家級實驗教學示范中心,；
2011年學生開放實驗室建成并正式運行,；大型醫(yī)學實驗模擬實驗應用開始試運行；
2012年獲首批上海高校創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)教育實驗基地,。
經過三十多年的發(fā)展,，檢驗系在教學設施、師資隊伍和辦學能力等方面得到顯著改善和發(fā)展,。2002年2月,，在瑞金醫(yī)院領導的關心支持下，醫(yī)學檢驗系整體搬遷至瑞金醫(yī)院科教大樓五樓,，教學環(huán)境得到了極大的改善,。2004年在原上海第二醫(yī)科大學支持下，與瑞金臨床醫(yī)學院實訓中心共同組成臨床技能實驗中心,，并于2007年被評為上海交通大學示范實驗室,。
近年來醫(yī)學檢驗系按照“定位明確、整體規(guī)劃,、不斷創(chuàng)新,、穩(wěn)步推進”的思路，以實驗空間,、技術體系,、學科建設、人才隊伍,、對外合作等為工作重點,。通過“211工程”三期建設、上海市教委本科教育高地三、四期的建設,，檢驗系的教學,、科研軟硬件設施建設得到了有效改善：已建成在互動形態(tài)學技術上的模擬操作平臺、在圖像分析技術上的細胞生物學平臺,、在臨床生化為基礎的臨床檢驗技術平臺及蛋白分析技術上的分子和蛋白組學平臺,、學生開放性實驗室建成并投入使用。引入實體聯(lián)合,、資源基地,、項目合作、戰(zhàn)略聯(lián)盟等形式,，在國內外逐步形成多個活躍的交流平臺,，為不同學制醫(yī)學生的學習和應用各類醫(yī)學實驗技術、臨床科研技能訓練及建立現(xiàn)代醫(yī)學教育模式打下了基礎,。
