當(dāng)前，新冠疫情防控進入了新階段。"隨著防疫措施逐步調(diào)整，對當(dāng)前疫情的規(guī)模和走向進行科學(xué)評估與預(yù)測，將對指導(dǎo)公眾和公共衛(wèi)生系統(tǒng)應(yīng)對此次疫情具有重要價值"。 上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院陳賽娟院士說，“為此，我們對上海地區(qū)今年秋冬季的感染者隨機抽樣研究，進行了新冠病毒基因組測序與分子流行病學(xué)分析。持續(xù)監(jiān)測國內(nèi)流行的新冠病毒種類，同時評估每個變異株的感染力和致病力，判斷疫情發(fā)展情況。”
陳賽娟院士還表示，近期出現(xiàn)新冠病毒感染癥狀的人群中，重癥主要集中在有基礎(chǔ)疾病的老年人群體中；元旦和春節(jié)即將到來，醫(yī)療資源相對薄弱的農(nóng)村地區(qū)，都是需要重點關(guān)注的。
自2019年12月以來，新型冠狀病毒在全球范圍內(nèi)流行。根據(jù)世界衛(wèi)生組織（WHO）統(tǒng)計結(jié)果，截止2022年12月23日，新冠疫情總共造成651,918,402人次感染，6,656,601例死亡。由于人體對新型病原體普遍缺乏免疫力，而且新冠病毒原始株和其衍生出的一系列變異株的感染力與毒性尚不明確，因此在新冠疫情出現(xiàn)之后，我國及時采取感染溯源、定點隔離、全員核酸檢測等公共衛(wèi)生防控措施和大力推行分層救治，在近三年里多次阻斷新冠病毒在境內(nèi)大規(guī)模擴散，有效地維護了人民群眾生命健康安全。
奧密克戎（英文名Omicron; Pango命名系統(tǒng)編號：B.1.1.159）是當(dāng)前世界衛(wèi)生組織指定的值得密切關(guān)注的新冠病毒變異株。相對于新冠病毒的早期變異株（如阿爾法、貝塔、伽馬、德爾塔），奧密克戎的感染能力、免疫逃逸能力顯著增強，但是其侵襲肺部引發(fā)重癥的毒性能力則顯著減弱。此外，依據(jù)國外多項研究、以及2022年上半年中國香港和上海地區(qū)奧密克戎疫情期間的患者臨床數(shù)據(jù)分析結(jié)果，雖然奧密克戎毒株能突破多數(shù)疫苗接種者或感染者的免疫屏障，但是接種2-3針滅活疫苗能有效降低奧密克戎感染后引發(fā)的重癥和死亡比例。因此，自2022年11月11日-2022年12月7日期間，國內(nèi)多個省市逐漸調(diào)整疫情防控措施，利用居民抗原檢測取代常規(guī)社區(qū)核酸檢測，鼓勵新冠病毒無癥狀感染者或出現(xiàn)輕型、普通型癥狀的患者居家隔離觀察和治療，集中資源來重點診治新冠感染高危人群（如高齡、三高（高血壓、高血脂、高血糖）、糖尿病、自身免疫缺陷疾病、尿毒癥、腫瘤等）。這些新的防疫措施被納入2022年12月26日國家正式頒布《新型冠狀病毒感染「乙類乙管」檢測方案》，將從2023年1月8日起施行。
為了評估調(diào)整疫情防護措施之后奧密克戎毒株在境內(nèi)的傳播模式、有癥狀感染者中重癥患者可能比例、以及此波疫情在大城市和中西部農(nóng)村的走勢，近期，上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院、轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)國家重大基礎(chǔ)設(shè)施（上海）陳賽娟團隊與上海市公共衛(wèi)生臨床中心范小紅團隊聯(lián)合攻關(guān)，在Frontiers of Medicine發(fā)表研究論文《初步分析我國2022年秋冬新冠疫情中奧密克戎亞型多樣性與流行病學(xué)特征》（Primary assessment of the diversity of Omicron sublineages and the epidemiologic features of autumn/winter 2022 COVID-19 wave in Chinese mainland）。分析當(dāng)前境內(nèi)流行的奧密克戎亞型種類，重癥危重癥患者在感染者及住院患者中的比例，并用數(shù)學(xué)建模對疫情走向進行模擬預(yù)測。
2022年秋冬季上海地區(qū)新冠病毒基因組測序與分子流行病學(xué)分析
對2022年秋冬期間上海公衛(wèi)中心收治的患者中隨機抽取的378例樣本進行基因組測序，獲得369個高質(zhì)量新冠病毒全基因組序列。分子進化樹分析發(fā)現(xiàn)，這些病毒基因組中共包含全球共享所有流感數(shù)據(jù)倡議（GISAID）數(shù)據(jù)庫里記錄的30個奧密克戎亞型毒株，其中355個（95.95%）基因組序列集中在5個奧密克戎亞系，主要毒株包括已報道在北京和廣州等地流行的BF.7和BA.5.2和近期歐美地區(qū)出現(xiàn)的BQ.1和XBB。結(jié)合感染者的旅行史和感染接觸史，證明有北京或廣州疫情接觸史者分別主要攜帶BF.7和BA.5.2亞株；從海外入境上海的感染者主要攜帶BQ.1和XBB；而上海本地感染者中除了BA.5.2以外，還有多個奧密克戎亞株相對占比較高。這些結(jié)果中尚未發(fā)現(xiàn)新的新冠病毒變異株。
2022年秋冬季新冠病毒患者重癥比列分析
由于抗擊新冠感染的任務(wù)已經(jīng)轉(zhuǎn)為防治重癥為主，研究團隊依據(jù)公開信息，對此波疫情截止2022年11月29日的重癥/危重癥患者數(shù)和感染者總數(shù)變化情況進行分析，發(fā)現(xiàn)重癥/危重癥人數(shù)隨感染者人數(shù)增長而增加，比例達到0.035%。根據(jù)一般規(guī)律，高危人群在入院2-3周后演變?yōu)橹匕Y危重癥患者。因此，研究團隊對2022年9月1日至2022年12月26日期間上海公衛(wèi)中心收治的5706名有癥狀新冠病毒感染患者臨床演變進行了分析，經(jīng)過綜合醫(yī)學(xué)觀察和診斷，其中5533名患者表現(xiàn)為輕型和普通型（總占比96.97%），其余173名患者進展成重癥/危重癥（總占比3.03%），其中包括20名僅有新冠感染者（0.35%）和153名伴有由新冠感染而加重的基礎(chǔ)疾病患者（總占比2.68%）。此外年齡偏高者 （55-60歲以上，p<0.0001） 和男性患者(p<0.0001)發(fā)展為重癥/危重癥的風(fēng)險顯著增高。
利用數(shù)學(xué)模型初步預(yù)測奧密克戎疫情走向
基于此前北京、廣州、上海、重慶等地常規(guī)核酸檢測的感染者數(shù)據(jù)，建立模擬感染者數(shù)量變化曲線的數(shù)學(xué)模型，對近期疫情發(fā)展趨勢進行評估和預(yù)測，初步判斷此輪奧密克戎疫情感染人數(shù)于2023年元旦前后在上述主要城市接近尾聲。然而，基于重慶市主城區(qū)和郊區(qū)數(shù)據(jù)的數(shù)學(xué)模擬分析，提示疫情峰值在郊區(qū)有所延后，且其感染峰值將在春運期間因疫情擴散加速而顯著增強。對于四川、陜西、甘肅、青海等省，在不計省會城市的人群中疫情進展情況進行預(yù)測，估計在農(nóng)村和中小城鎮(zhèn)地區(qū)的感染峰值將于2023年1月中下旬出現(xiàn)，由于春運原因，這些峰值也可能提前到達。
總結(jié)
以上分析結(jié)果提示，隨著疫情演變帶來的病毒傳播途徑的變化，多個奧密克戎亞型在國內(nèi)同時傳播；近期出現(xiàn)新冠病毒感染癥狀的人群中，重癥主要集中在有基礎(chǔ)疾病的老年人群體中；元旦之后到春節(jié)期間，新冠疫情將主要影響農(nóng)村和中小城鎮(zhèn)地區(qū)。值得特別關(guān)注的是，國內(nèi)農(nóng)村和中小城鎮(zhèn)地區(qū)醫(yī)療資源相對匱乏，且有大量老年人和有基礎(chǔ)疾病人群；春運期間城市和農(nóng)村人口流動性將極大影響疫情走向。因此，當(dāng)前急需為奧密克戎疫情向農(nóng)村地區(qū)擴散啟動應(yīng)急計劃，將更多醫(yī)療資源配置到農(nóng)村基層，做好有效藥物和新型疫苗的應(yīng)急使用許可，做好抗新冠病毒特異藥物及輔助性藥物、療效確切的中藥的生產(chǎn)儲備、分配和臨床合理使用；實施分類、分層治療，加強中小城鎮(zhèn)重癥救治能力；繼續(xù)精準用好非藥物性公共衛(wèi)生措施（在室內(nèi)空間佩戴N95口罩、保持社交距離、公共交通工具適當(dāng)增加班次以避免人群過于擁擠等），努力削減疫情峰值，緩解醫(yī)療系統(tǒng)和醫(yī)務(wù)人員的沉重壓力；繼續(xù)做好高危人群全程免疫接種，啟動高風(fēng)險人群的第四針免疫加強針接種；加強個人家庭防控知識技能普及，做好健康宣傳和風(fēng)險溝通，保護人民群眾特別是困難群體的生命健康，確保我國平穩(wěn)走出疫情，促進社會經(jīng)濟有序恢復(fù)發(fā)展。
【論文中文原文鏈接】
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