近日，《Nucleic Acids
Research》在線發(fā)表了上海交通大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院細(xì)胞分化與凋亡教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室張健研究員課題組的最新研究成果：ASD v2.0:
updated content and novel features focusing on allosteric
regulation。
在前期工作(Nucleic Acids Research, 2011; Bioinformatics,
2013)基礎(chǔ)上，張健課題組在本工作中進(jìn)一步闡明了生命體內(nèi)大分子最常見(jiàn)調(diào)節(jié)方式-別構(gòu)調(diào)節(jié)發(fā)生的多樣性及其基本規(guī)律。Allosteric
regulation（別構(gòu)調(diào)節(jié)），是指利用調(diào)節(jié)物（配體或其它分子）結(jié)合在蛋白質(zhì)活性位點(diǎn)以外的位點(diǎn)（別構(gòu)位點(diǎn)）所產(chǎn)生的一種直接、快速、有效的蛋白質(zhì)功能、結(jié)構(gòu)或適應(yīng)性的調(diào)節(jié)方式，參與細(xì)胞代謝，信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)等重要生命過(guò)程，其發(fā)生規(guī)律一直是科學(xué)家們亟待解決的關(guān)鍵問(wèn)題。
課題組通過(guò)生物信息學(xué)和藥物化學(xué)方法擴(kuò)展了已知?jiǎng)e構(gòu)功能蛋白、活性小分子及潛在別構(gòu)相關(guān)疾病，建立了大規(guī)模別構(gòu)位點(diǎn)的分布特征及相互作用圖譜，總結(jié)鑒定超過(guò)40種蛋白從別構(gòu)位點(diǎn)到底物位點(diǎn)的別構(gòu)通路及遠(yuǎn)程調(diào)控作用機(jī)制，發(fā)展了從小分子到蛋白的多種生物信息學(xué)別構(gòu)識(shí)別工具。該工作有助于揭示多種臨床發(fā)現(xiàn)疾病相關(guān)突變的別構(gòu)機(jī)制，并為制藥公司發(fā)展別構(gòu)類型藥物小分子提供了重要開(kāi)發(fā)工具和指導(dǎo)性的策略。
張健課題組一直致力于綜合利用生物學(xué)、化學(xué)和信息學(xué)開(kāi)展重大疾病靶標(biāo)識(shí)別和活性藥物小分子發(fā)現(xiàn)的研究。論文第一作者黃志敏系張健研究員博士研究生。此項(xiàng)成果得到國(guó)家自然科學(xué)基金優(yōu)秀青年基金及教育部新世紀(jì)優(yōu)秀人才項(xiàng)目的資助。
全文鏈接：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24293647
