11月8日，上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬仁濟(jì)醫(yī)院消化科陳豪燕和洪潔團(tuán)隊在Cell子刊《細(xì)胞·宿主與微生物》（Cell Host & Microbe）以推薦論文(Featured Article)形式在線發(fā)表重要研究成果，首次揭示了腸道真菌譜具有預(yù)測腫瘤免疫治療療效的作用，且腸道真菌預(yù)測準(zhǔn)確性更高。該研究為篩選腫瘤免疫治療的應(yīng)答者，從而提高免疫治療的適用性提供了新思路。
腫瘤免疫檢查點抑制劑(immune checkpoint blockade，ICB)是癌癥治療的重大突破。然而，只有一小部分癌癥患者對免疫檢查點抑制劑治療有應(yīng)答反應(yīng)。近年來，越來越多的研究報道了腸道細(xì)菌結(jié)構(gòu)能影響癌癥患者使用免疫檢查點抑制劑的有效性。然而，人體腸道菌群的構(gòu)成主要由飲食和生活方式?jīng)Q定，不同地區(qū)或人種間的腸道菌群構(gòu)成存在明顯差異。因此，先前研究中關(guān)于免疫檢查點抑制劑療效相關(guān)的腸道菌群特征結(jié)果并不一致。
陳豪燕和洪潔團(tuán)隊的研究整合了來自不同國家、不同腫瘤類型的使用ICB治療的9個宏基因組隊列，同時計算了腸道真菌及細(xì)菌雙界微生物組，發(fā)現(xiàn)了可用于預(yù)測ICB治療應(yīng)答的真菌及細(xì)菌標(biāo)志物。研究團(tuán)隊通過構(gòu)建隨機(jī)森林模型，預(yù)測癌癥患者對免疫檢查點抑制劑的應(yīng)答反應(yīng)。結(jié)果顯示，腸道真菌具有良好的預(yù)測效能且其預(yù)測效能比細(xì)菌更高。此外，整合細(xì)菌及真菌雙界標(biāo)志物進(jìn)行預(yù)測時會達(dá)到最好的預(yù)測效果。根據(jù)真菌標(biāo)志物預(yù)測的應(yīng)答者腫瘤免疫微環(huán)境中有更多的耗竭性T細(xì)胞浸潤，且該類患者的生存期優(yōu)于不應(yīng)答者。雙界網(wǎng)絡(luò)分析及微生物功能預(yù)測分析表明，真菌Schizosaccharomyces octosporus可能在應(yīng)答者腸道中將淀粉發(fā)酵成短鏈脂肪酸，從而促進(jìn)免疫檢查點抑制劑治療的應(yīng)答。
這項研究首次揭示了腫瘤免疫檢查點應(yīng)答者及不應(yīng)答者全面的泛癌腸道真菌譜，發(fā)現(xiàn)了具有良好預(yù)測性能的雙界微生物標(biāo)記物，突出了真菌在預(yù)測免疫治療療效方面的潛力，有望提高免疫檢查點抑制劑治療的適用性，為利用這些標(biāo)志物預(yù)測免疫檢查點抑制劑療效、改善應(yīng)答提供新思路。
附屬仁濟(jì)醫(yī)院消化科博士研究生黃孝雯、博士研究生胡慕妮、主治醫(yī)師孫甜甜、附屬胸科醫(yī)院腫瘤科主治醫(yī)師李劍濤和附屬仁濟(jì)醫(yī)院消化科博士后周一蘆為該論文的共同第一作者，附屬仁濟(jì)醫(yī)院消化科陳豪燕研究員和洪潔研究員為論文的共同通訊作者。本研究還得到了消化科主任房靜遠(yuǎn)教授的大力支持。
