11月8日,，上海交通大學醫(yī)學院附屬仁濟醫(yī)院消化科陳豪燕和洪潔團隊在Cell子刊《細胞·宿主與微生物》（Cell Host & Microbe）以推薦論文(Featured Article)形式在線發(fā)表重要研究成果，首次揭示了腸道真菌譜具有預測腫瘤免疫治療療效的作用,，且腸道真菌預測準確性更高,。該研究為篩選腫瘤免疫治療的應答者，從而提高免疫治療的適用性提供了新思路,。
腫瘤免疫檢查點抑制劑(immune checkpoint blockade,，ICB)是癌癥治療的重大突破。然而,，只有一小部分癌癥患者對免疫檢查點抑制劑治療有應答反應,。近年來，越來越多的研究報道了腸道細菌結構能影響癌癥患者使用免疫檢查點抑制劑的有效性,。然而,，人體腸道菌群的構成主要由飲食和生活方式決定，不同地區(qū)或人種間的腸道菌群構成存在明顯差異,。因此,，先前研究中關于免疫檢查點抑制劑療效相關的腸道菌群特征結果并不一致。
陳豪燕和洪潔團隊的研究整合了來自不同國家,、不同腫瘤類型的使用ICB治療的9個宏基因組隊列,，同時計算了腸道真菌及細菌雙界微生物組,，發(fā)現(xiàn)了可用于預測ICB治療應答的真菌及細菌標志物。研究團隊通過構建隨機森林模型,，預測癌癥患者對免疫檢查點抑制劑的應答反應,。結果顯示，腸道真菌具有良好的預測效能且其預測效能比細菌更高,。此外,，整合細菌及真菌雙界標志物進行預測時會達到最好的預測效果。根據真菌標志物預測的應答者腫瘤免疫微環(huán)境中有更多的耗竭性T細胞浸潤,，且該類患者的生存期優(yōu)于不應答者,。雙界網絡分析及微生物功能預測分析表明，真菌Schizosaccharomyces octosporus可能在應答者腸道中將淀粉發(fā)酵成短鏈脂肪酸,，從而促進免疫檢查點抑制劑治療的應答,。
這項研究首次揭示了腫瘤免疫檢查點應答者及不應答者全面的泛癌腸道真菌譜，發(fā)現(xiàn)了具有良好預測性能的雙界微生物標記物,，突出了真菌在預測免疫治療療效方面的潛力,，有望提高免疫檢查點抑制劑治療的適用性，為利用這些標志物預測免疫檢查點抑制劑療效,、改善應答提供新思路,。
附屬仁濟醫(yī)院消化科博士研究生黃孝雯、博士研究生胡慕妮,、主治醫(yī)師孫甜甜,、附屬胸科醫(yī)院腫瘤科主治醫(yī)師李劍濤和附屬仁濟醫(yī)院消化科博士后周一蘆為該論文的共同第一作者，附屬仁濟醫(yī)院消化科陳豪燕研究員和洪潔研究員為論文的共同通訊作者,。本研究還得到了消化科主任房靜遠教授的大力支持,。
