隨著醫(yī)學(xué)技術(shù)的日益發(fā)展,罕見病已不再“罕見”,。附屬上海兒童醫(yī)學(xué)中心分子遺傳團隊近日在醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)權(quán)威學(xué)術(shù)雜志《Genetics in Medicine》(影響因子9.937)發(fā)表了關(guān)于如何利用二代測序技術(shù)在中國開展對兒科罕見遺傳病的分子診斷的研究結(jié)果,。研究表明國內(nèi)目前在臨床遺傳醫(yī)師、遺傳咨詢師等專業(yè)人員匱乏的狀態(tài)下,,將“患兒醫(yī)學(xué)外顯子組基因測序(Proband-only Medical Exome Sequencing,,POMES)”作為臨床疑似病例首選的遺傳學(xué)檢測項目,具有較高的經(jīng)濟性和臨床有效性,。這一方案同時解決了二代測序成本高,、以及臨床醫(yī)生分子遺傳背景參差兩個最棘手的問題。
二代測序技術(shù)近年來在西方發(fā)達國家的罕見遺傳病診斷中正逐漸得到廣泛應(yīng)用,。上海兒童醫(yī)學(xué)中心利用POMES方案不依賴于大量的臨床評估與診斷,,臨床醫(yī)生不需要根據(jù)病人的臨床表型選擇不同的二代測序方案,既降低了對臨床醫(yī)生醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)知識的要求,,也避免了因為選擇偏差而導(dǎo)致的延長確診周期和增加病人負(fù)擔(dān),。
該項目負(fù)責(zé)人上海兒童醫(yī)學(xué)中心分子診斷實驗室主任王劍研究員介紹,POMES方案靶向近3000個已知的疾病致病基因,,僅就患者行二代測序篩查,用一代測序方法驗證突變來源與致病性,。相比歐美國家采用一家三口全外顯子組測序的做法,,POMES大大降低了病人的經(jīng)濟負(fù)擔(dān)。截止2018年12月,,該方案已經(jīng)檢測了7000多例臨床疑似遺傳病樣本,,診斷明確了近3000例罕見疑難病例,約400余種,,其中至少50種為國內(nèi)首先報道,。
上海兒童醫(yī)學(xué)中心罕見病診治中心陳靜主任表示,罕見病大多數(shù)是由于基因缺陷所致,,由于種類繁多,、表型復(fù)雜多樣,使臨床診斷和有效治療非常困難。近年來,,兒中心在上海市率先開設(shè)“罕見疑難病聯(lián)合門診”與“醫(yī)學(xué)遺傳聯(lián)合門診”,,開展罕見疑難病臨床多學(xué)科會診與專業(yè)的遺傳咨詢等。醫(yī)院于2011年成立了“上海兒童醫(yī)學(xué)中心-哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院波士頓兒童醫(yī)院分子遺傳診斷聯(lián)合實驗室”,。目前實驗室能夠完成從單個堿基到整條染色體變異的所有遺傳學(xué)實驗,,是國內(nèi)最早開展臨床高通量測序和基因芯片檢測的實驗室之一,能夠?qū)?000多種罕見遺傳病開展基因診斷,。通過臨床病例表型與基因組大數(shù)據(jù)積累,,初步搭建了中國人群兒童罕見遺傳病數(shù)據(jù)庫,并逐步建立“人工智能”基因組變異解讀系統(tǒng),,掌握了部分罕見遺傳病在中國人群中的發(fā)病規(guī)律與基因突變譜,,并為4000多個家庭提供了遺傳咨詢,指導(dǎo)協(xié)助產(chǎn)前診斷1000多例,、植入前診斷100余例,。
與此同時,醫(yī)院也積極探索罕見病治療,,在國內(nèi)率先開展免疫缺陷,、遺傳代謝病等幾十種罕見病的造血干細(xì)胞移植治療,目前已累計治療250例,。2017年,,由上海兒童醫(yī)學(xué)中心為核心單位,上海市罕見病防治基金會聯(lián)合國內(nèi)各個領(lǐng)域的112名專家歷時一年多編寫完成國內(nèi)首部罕見病專著《可治性罕見病》問世,,收錄了117種目前可以被明確診斷,,并有治療方案的罕見病。
“今年,,兒科專家將再度聯(lián)手,,將在罕見病日推出又一部罕見病專著,這將為中國認(rèn)識罕見病,,推動罕見病診治工作貢獻我們的力量,!”陳靜教授表示。