隨著醫(yī)學(xué)技術(shù)的日益發(fā)展，罕見(jiàn)病已不再“罕見(jiàn)”。附屬上海兒童醫(yī)學(xué)中心分子遺傳團(tuán)隊(duì)近日在醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)權(quán)威學(xué)術(shù)雜志《Genetics in Medicine》（影響因子9.937）發(fā)表了關(guān)于如何利用二代測(cè)序技術(shù)在中國(guó)開(kāi)展對(duì)兒科罕見(jiàn)遺傳病的分子診斷的研究結(jié)果。研究表明國(guó)內(nèi)目前在臨床遺傳醫(yī)師、遺傳咨詢(xún)師等專(zhuān)業(yè)人員匱乏的狀態(tài)下，將“患兒醫(yī)學(xué)外顯子組基因測(cè)序（Proband-only Medical Exome Sequencing，POMES）”作為臨床疑似病例首選的遺傳學(xué)檢測(cè)項(xiàng)目，具有較高的經(jīng)濟(jì)性和臨床有效性。這一方案同時(shí)解決了二代測(cè)序成本高、以及臨床醫(yī)生分子遺傳背景參差兩個(gè)最棘手的問(wèn)題。
二代測(cè)序技術(shù)近年來(lái)在西方發(fā)達(dá)國(guó)家的罕見(jiàn)遺傳病診斷中正逐漸得到廣泛應(yīng)用。上海兒童醫(yī)學(xué)中心利用POMES方案不依賴(lài)于大量的臨床評(píng)估與診斷，臨床醫(yī)生不需要根據(jù)病人的臨床表型選擇不同的二代測(cè)序方案，既降低了對(duì)臨床醫(yī)生醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)知識(shí)的要求，也避免了因?yàn)檫x擇偏差而導(dǎo)致的延長(zhǎng)確診周期和增加病人負(fù)擔(dān)。
該項(xiàng)目負(fù)責(zé)人上海兒童醫(yī)學(xué)中心分子診斷實(shí)驗(yàn)室主任王劍研究員介紹，POMES方案靶向近3000個(gè)已知的疾病致病基因，僅就患者行二代測(cè)序篩查，用一代測(cè)序方法驗(yàn)證突變來(lái)源與致病性。相比歐美國(guó)家采用一家三口全外顯子組測(cè)序的做法，POMES大大降低了病人的經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)。截止2018年12月，該方案已經(jīng)檢測(cè)了7000多例臨床疑似遺傳病樣本，診斷明確了近3000例罕見(jiàn)疑難病例，約400余種，其中至少50種為國(guó)內(nèi)首先報(bào)道。
上海兒童醫(yī)學(xué)中心罕見(jiàn)病診治中心陳靜主任表示，罕見(jiàn)病大多數(shù)是由于基因缺陷所致，由于種類(lèi)繁多、表型復(fù)雜多樣，使臨床診斷和有效治療非常困難。近年來(lái)，兒中心在上海市率先開(kāi)設(shè)“罕見(jiàn)疑難病聯(lián)合門(mén)診”與“醫(yī)學(xué)遺傳聯(lián)合門(mén)診”，開(kāi)展罕見(jiàn)疑難病臨床多學(xué)科會(huì)診與專(zhuān)業(yè)的遺傳咨詢(xún)等。醫(yī)院于2011年成立了“上海兒童醫(yī)學(xué)中心-哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院波士頓兒童醫(yī)院分子遺傳診斷聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室”。目前實(shí)驗(yàn)室能夠完成從單個(gè)堿基到整條染色體變異的所有遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn)，是國(guó)內(nèi)最早開(kāi)展臨床高通量測(cè)序和基因芯片檢測(cè)的實(shí)驗(yàn)室之一，能夠?qū)?000多種罕見(jiàn)遺傳病開(kāi)展基因診斷。通過(guò)臨床病例表型與基因組大數(shù)據(jù)積累，初步搭建了中國(guó)人群兒童罕見(jiàn)遺傳病數(shù)據(jù)庫(kù)，并逐步建立“人工智能”基因組變異解讀系統(tǒng)，掌握了部分罕見(jiàn)遺傳病在中國(guó)人群中的發(fā)病規(guī)律與基因突變譜，并為4000多個(gè)家庭提供了遺傳咨詢(xún)，指導(dǎo)協(xié)助產(chǎn)前診斷1000多例、植入前診斷100余例。
與此同時(shí)，醫(yī)院也積極探索罕見(jiàn)病治療，在國(guó)內(nèi)率先開(kāi)展免疫缺陷、遺傳代謝病等幾十種罕見(jiàn)病的造血干細(xì)胞移植治療，目前已累計(jì)治療250例。2017年，由上海兒童醫(yī)學(xué)中心為核心單位，上海市罕見(jiàn)病防治基金會(huì)聯(lián)合國(guó)內(nèi)各個(gè)領(lǐng)域的112名專(zhuān)家歷時(shí)一年多編寫(xiě)完成國(guó)內(nèi)首部罕見(jiàn)病專(zhuān)著《可治性罕見(jiàn)病》問(wèn)世，收錄了117種目前可以被明確診斷，并有治療方案的罕見(jiàn)病。
“今年，兒科專(zhuān)家將再度聯(lián)手，將在罕見(jiàn)病日推出又一部罕見(jiàn)病專(zhuān)著，這將為中國(guó)認(rèn)識(shí)罕見(jiàn)病，推動(dòng)罕見(jiàn)病診治工作貢獻(xiàn)我們的力量！”陳靜教授表示。
