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附屬九院范先群團(tuán)隊(duì)揭示lncRNA ROR染色體構(gòu)象調(diào)控葡萄膜黑色素瘤發(fā)生新機(jī)制
2019-09-02 瀏覽( 來源:第九人民醫(yī)院 
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  美國基因和細(xì)胞治療學(xué)會官方雜志Molecular Therapy近日發(fā)表上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第九人民醫(yī)院范先群教授團(tuán)隊(duì)研究成果“A Cohesin-Mediated Intrachromosomal Loop Drives Oncogenic ROR lncRNA to Accelerate Tumorigenesis”。該研究揭示了長鏈非編碼ROR(lncRNA-ROR)通過形成染色體內(nèi)環(huán)構(gòu)象,激活內(nèi)源性表達(dá),從而促進(jìn)葡萄膜黑色素瘤(Uveal Melanoma ,UM)發(fā)生發(fā)展的新機(jī)制。

  UM是成人最常見的眼內(nèi)惡性原發(fā)性腫瘤,惡性程度高,極易通過血行轉(zhuǎn)移至全身重要器官尤其是肝臟,死亡率高,嚴(yán)重威脅患者視力和生命安全。范先群教授團(tuán)隊(duì)長期從事眼內(nèi)惡性腫瘤發(fā)生機(jī)制研究,2015年12月課題組首次在國際著名學(xué)術(shù)期刊《Genome Biology》提出UM發(fā)生中基于長鏈非編碼ROR(lncRNA-ROR)的陷阱修飾學(xué)說,被F1000評價(jià)為“揭示腫瘤發(fā)生新機(jī)制,是腫瘤研究的范例”。在此基礎(chǔ)上,利用豐富的臨床樣本和動物模型隊(duì)列,范先群教授帶領(lǐng)眼腫瘤團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步挖掘UM發(fā)生中l(wèi)ncRNAROR異常轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)理。在該研究中,研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)LncRNAROR核心啟動區(qū)和其上游DNA形成由SMC1蛋白介導(dǎo)的染色體內(nèi)環(huán)構(gòu)象,從而激活內(nèi)源性ROR表達(dá),促進(jìn)腫瘤發(fā)生。而敲除其中構(gòu)象內(nèi)的DNA片段或構(gòu)象形成蛋白SMC1,均可導(dǎo)致ROR內(nèi)環(huán)構(gòu)象消失,同時(shí)lncRNAROR表達(dá)量下降。

  該研究結(jié)果對lncRNA在腫瘤發(fā)生中的功能及轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)理有了全新的認(rèn)識,為腫瘤診斷提供潛在的新靶點(diǎn),也為其他疾病中l(wèi)ncRNA 的功能研究提供新的思路。

  范佳燕、徐揚(yáng)帆和文旭洋為該論文共同第一作者,范先群、張赫、賈仁兵為共同通訊作者,上海市眼眶病眼腫瘤重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室葛盛芳對該文也做出貢獻(xiàn)。論文獲國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、國家自然科學(xué)基金委、上海市科學(xué)技術(shù)委員會等資助。

  論文原文鏈接:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31451355

 
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