癌癥是全球主要的公共衛(wèi)生問題,,且成為我國第三大、美國第二大死亡原因,?!杜R床腫瘤雜志》“CA”期刊發(fā)布的2021年癌癥統(tǒng)計(jì)報告顯示,無論是在男性還是女性中,,結(jié)直腸癌的發(fā)病率和死亡率都位居第三,,極大地加重了社會負(fù)擔(dān),因此亟需新的結(jié)直腸癌早篩方法和治療方案用于臨床,。最近大量研究表明,,結(jié)直腸癌的發(fā)生發(fā)展與腸道微生物組的改變密切相關(guān),而腸道微生物組包括細(xì)菌,、真菌,、古菌和病毒四界微生物組,,因此,對于結(jié)直腸癌發(fā)生發(fā)展的機(jī)制圍繞腸道微生物組四個界別的微生物開展整體的,、客觀的和系統(tǒng)的研究,,尚屬空白。

近日,,上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院公共衛(wèi)生學(xué)院王慧教授聯(lián)合同濟(jì)大學(xué)朱瑞新教授,、中科院上海營養(yǎng)與健康研究所張國慶教授、復(fù)旦大學(xué)陳興棟教授和中山大學(xué)附屬第六醫(yī)院朱立新教授團(tuán)隊(duì),,在國際知名期刊《自然微生物》雜志(Nature Microbiology)發(fā)表了題為Multi-kingdom microbiota analyses identify bacterial–fungal interactions and biomarkers of colorectal cancer across cohorts的研究論文,,該研究針對結(jié)直腸癌患者腸道菌群的四界微生物組進(jìn)行多中心隊(duì)列研究,分析和繪制了全球八個結(jié)直腸癌人群隊(duì)列的四界微生物組圖譜,,發(fā)現(xiàn)結(jié)直腸癌特異的細(xì)菌-真菌互作新機(jī)制,,為結(jié)直腸癌診斷提供了基于微生物及其功能標(biāo)志物的新方法。
該研究整合了全球8個國家/地區(qū)的結(jié)直腸癌隊(duì)列共1368例標(biāo)本的宏基因組數(shù)據(jù),,不僅發(fā)現(xiàn)了可用于結(jié)直腸癌診斷的單界別微生物菌株標(biāo)志物(27個細(xì)菌,、20個真菌、20個古菌和21個病毒物種),,還首次發(fā)現(xiàn)了準(zhǔn)確性更高的多界別最小核心菌群(11個細(xì)菌,、4個真菌和1個古菌),此外,,通過宏基因組功能預(yù)測,,結(jié)直腸癌患者腸道菌群的D-氨基酸代謝和丁酸鹽代謝水平顯著升高??傊?,該研究不僅揭示了不同地域人群中普遍存在的結(jié)直腸癌特異的微生物標(biāo)志物,同時驗(yàn)證了四界微生物組作為結(jié)直腸癌診斷輔助工具的可行性,,并進(jìn)一步提出了微生物及其相關(guān)功能基因作為治療結(jié)直腸癌潛在靶點(diǎn)的可能性,,為結(jié)直腸癌早期診斷和預(yù)后評估提供了基于微生物及其功能標(biāo)志物的新方法和新思路。

該研究得到了國家科技部重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃,、國家自然科學(xué)基金,、上海市科委和衛(wèi)健委等項(xiàng)目的資助,第一作者和最后通訊作者單位為上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院,。上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院公共衛(wèi)生學(xué)院劉寧寧研究員,、浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬兒童醫(yī)院焦娜研究員、上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院公共衛(wèi)生學(xué)院碩士研究生譚鏡璁,、上海市中醫(yī)醫(yī)院王子良研究員為論文的共同第一作者,。該項(xiàng)目還得到了合作方中國科學(xué)院趙國屏院士、海軍軍醫(yī)大學(xué)廖萬清院士,、海軍軍醫(yī)大學(xué)潘煒華教授,、海軍軍醫(yī)大學(xué)方文捷博士,、美國農(nóng)業(yè)部農(nóng)業(yè)研究局Geromy G. Moore教授、上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院單細(xì)胞組學(xué)與疾病研究中心Christopher Heeschen教授,、世界衛(wèi)生組織國際癌癥研究署Zisis Kozlakidis教授的大力支持和幫助,。
感謝論文三位審稿人Ran Blekhman, Aleksandar Kostic和George Miller,對該項(xiàng)工作給予了高度評價:“All my concerns have been addressed. I believe that this is an important contribution.” “I would like to congratulate the authors on this interesting and comprehensive study. My concerns have been sufficiently addressed.”