世界衛(wèi)生組織提出抗微生物耐藥性(AMR)是本世紀(jì)人類健康最嚴(yán)重的威脅之一，尤其是在“后抗生素時(shí)代”新抗生素研發(fā)顯著滯后于耐藥細(xì)菌出現(xiàn)的背景下。現(xiàn)今，全球73%的抗微生物藥物被用于促進(jìn)食用動(dòng)物（主要是雞和豬）生長和疾病的預(yù)防，食用動(dòng)物被認(rèn)為是AMR的重要貯存宿主和來源。因此，開展食用動(dòng)物源細(xì)菌的耐藥性監(jiān)測對于AMR的控制具有重要意義。同時(shí)，這也是整合動(dòng)物、環(huán)境和人類三個(gè)層面的全健康理念的重要范疇之一。崇明島位于長江入海口，是全國第三大島嶼，也是上海市重要的食品來源基地之一。崇明島相對獨(dú)立的地理優(yōu)勢和較為完善的食用動(dòng)物養(yǎng)殖體系為AMR防控相關(guān)的實(shí)踐提供了較理想的條件。
近期，上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院全球健康學(xué)院動(dòng)物健康與食品安全系博士研究生呂超等在Infectious Diseases of Poverty雜志發(fā)表了“Dynamic antimicrobial resistant patterns ofEscherichia colifrom healthy poultry and swine over 10 years in Chongming Island, Shanghai”的研究論文，依托于交大全健康研究中心崇明基地，系統(tǒng)分析崇明島2009-2021年的雞和豬來源大腸埃希菌耐藥數(shù)據(jù)，探究了崇明島食用動(dòng)物源大腸埃希菌AMR的動(dòng)態(tài)模式。
本研究通過收集崇明島2009-2021年4個(gè)雞養(yǎng)殖場和9個(gè)豬養(yǎng)殖場945株健康動(dòng)物源大腸埃希菌菌株，選擇常用的10類抗菌藥物的15種抗菌藥物通過微量肉湯稀釋法測定菌株的耐藥表型。利用描述性方法、廣義線性混合模型和共現(xiàn)分析對現(xiàn)有的表型數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。
數(shù)據(jù)分析結(jié)果顯示945株菌株中，863株為多重耐藥(MDR)菌株（對三類及以上抗菌藥物耐藥），集中在4-8類。豬和雞來源菌株對四環(huán)素類、氯霉素類、磺胺類、青霉素類和氨基糖苷類（僅豬來源菌株）的耐藥率均超過70.0%，其中豬來源菌株對氯霉素類耐藥率最高，為92.6%，雞來源菌株對四環(huán)素耐藥率（86.4%）最高。豬來源菌株對青霉素類、氨基糖苷類、四環(huán)素類、氯霉素類和多肽類的耐藥率顯著高于雞來源菌株，而雞來源菌株對氯霉素類的耐藥率顯著高于豬來源菌株。945株菌株中僅發(fā)現(xiàn)1株對碳青霉類（美羅培南）耐藥菌株。耐藥率動(dòng)態(tài)變化分析表明，雞和豬來源菌株對多肽類（黏菌素）的耐藥率均呈現(xiàn)下降趨勢，2016年后耐藥率基本降為0。豬源菌株對其他7類（碳青霉烯類和青霉素類除外）藥物的耐藥率基本呈現(xiàn)下降趨勢，尤其2016年以后。而雞來源的菌株對7類藥物的耐藥率呈現(xiàn)不同的下降趨勢。對多重耐藥菌株的深入研究發(fā)現(xiàn)，部分多重耐藥菌株在多個(gè)年份出現(xiàn)，提示可能一直在養(yǎng)殖場環(huán)境中存在,但雞和豬來源菌株的多重耐藥組合模式和出現(xiàn)的年份并不相同。通過泊松分布廣義線性模型（GLMMs）對AMR carriage檢驗(yàn)發(fā)現(xiàn)，2016-2021年的菌株AMR carriage顯著低于2009（OR<1），提示MDR出現(xiàn)風(fēng)險(xiǎn)正在降低。通過共現(xiàn)分析發(fā)現(xiàn)，青霉素類-氯霉素類-氟喹諾酮類是雞菌株中最常見的多重耐藥組合，氨基糖苷類-四環(huán)素類-磺胺類-氯霉素類是豬菌株中最常見的耐藥組合。
本研究表明，崇明島食用動(dòng)物源細(xì)菌多重耐藥仍然是一個(gè)亟待解決的問題。但崇明島動(dòng)物源細(xì)菌耐藥已經(jīng)出現(xiàn)明顯好轉(zhuǎn)的趨勢，反映在頭孢類、黏菌素和碳青霉烯類的低耐藥率；其他類藥物耐藥率下降的趨勢（尤其是豬）以及MDR流行率的降低，同時(shí)，本研究結(jié)果也顯示豬和雞來源菌株不同的耐藥動(dòng)態(tài)變化模式。本研究為崇明全球生態(tài)島制定AMR處置策略提供參考和依據(jù)。
上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院全球健康學(xué)院呂超博士研究生和上海市動(dòng)物疫控中心商軍、張文剛高級(jí)獸醫(yī)師為共同第一作者，全球健康學(xué)院朱泳璋副教授、郭曉奎教授和上海市動(dòng)物疫控中心黃仕新研究員為該論文的共同通訊作者。本研究得到了國家自然科學(xué)基金（No：32170141）、中華醫(yī)學(xué)會(huì)（No.20-365）和上海交通大學(xué)綜合創(chuàng)新基金（No.2020-01）的支持。
