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Chemical Society Reviews|全球健康學(xué)院環(huán)境健康與生態(tài)安全系殷堃團(tuán)隊(duì)發(fā)表綜述:基于CRISPR/Cas系統(tǒng)的無擴(kuò)增檢測技術(shù)
2023-02-14 瀏覽( 來源:全球健康學(xué)院 
 撰稿:李慧敏 殷堃
 攝影:

快速準(zhǔn)確的分子診斷在生命科學(xué),、食品安全,、環(huán)境監(jiān)測等領(lǐng)域發(fā)揮重要作用?;赑CR或下一代測序技術(shù)的方法具有高準(zhǔn)確度,,但存在反應(yīng)耗時(shí)長、分析程序復(fù)雜,、儀器體積大和依賴專業(yè)人員操作等問題,。近年來,基于規(guī)律成簇的間隔短回文重復(fù)序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,,CRISPR)/CRIPSR相關(guān)(CRISPR-associated,Cas)系統(tǒng)的檢測技術(shù)快速發(fā)展,,由于其具有強(qiáng)特異性和可編程性,,且易與現(xiàn)場即時(shí)監(jiān)測設(shè)備相結(jié)合,已在分子診斷領(lǐng)域展現(xiàn)出巨大潛力,。然而,,基于CRISPR/Cas的檢測方法通常需要核酸靶標(biāo)預(yù)擴(kuò)增步驟來提高分析物的濃度,延長了檢測時(shí)間,,并增加氣溶膠污染的風(fēng)險(xiǎn),,從而影響檢測準(zhǔn)確性。因此,,各種基于CRISPR/Cas的無靶標(biāo)擴(kuò)增(amplification-free)檢測策略被開發(fā)出來,,旨在克服上述局限性,最大限度地減少因缺乏預(yù)擴(kuò)增而導(dǎo)致的靈敏度損失,,并利于非核酸靶標(biāo)檢測和便攜式設(shè)備集成,。

近期,上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院-國家熱帶病研究中心全球健康學(xué)院環(huán)境健康與生態(tài)安全系碩士研究生李慧敏等在Chemical Society Reviews雜志發(fā)表了“Amplification-free CRISPR/Cas detection technology: challenges, strategies, and perspectives”的綜述性文章,,對基于CRISPR/Cas系統(tǒng)的無擴(kuò)增檢測技術(shù)的近期成果進(jìn)行了系統(tǒng)性總結(jié)歸納,,并提出了該領(lǐng)域面臨的挑戰(zhàn)以及未來展望。

本文首先綜述了基于無擴(kuò)增的CRISPR/Cas檢測技術(shù)的發(fā)展現(xiàn)狀和面臨的挑戰(zhàn),進(jìn)而重點(diǎn)介紹了提升無擴(kuò)增CRISPR/ Cas技術(shù)檢測靈敏度的四種主要策略:優(yōu)化CRISPR/Cas反應(yīng)的關(guān)鍵參數(shù),、數(shù)字化靈敏檢測平臺(tái),、偶聯(lián)其他靈敏信號(hào)傳感器以及設(shè)計(jì)級(jí)聯(lián)反應(yīng)實(shí)現(xiàn)輸出信號(hào)放大。最后,,本文進(jìn)一步討論了基于無擴(kuò)增CRISPR/Cas檢測技術(shù)未來展望,,包括實(shí)現(xiàn)各獨(dú)立反應(yīng)標(biāo)準(zhǔn)化、降低檢測成本,、形成整合的檢測平臺(tái)以適應(yīng)現(xiàn)場即時(shí)檢測的需求,,以及無擴(kuò)增靶標(biāo)多重檢測,這些進(jìn)一步優(yōu)化將有助于開發(fā)更有效的生物傳感策略,,使CRISPR/Cas檢測技術(shù)成為真正理想的分子診斷工具,。

上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院-國家熱帶病研究中心全球健康學(xué)院碩士研究生李慧敏和碩士研究生解藝為共同第一作者,全球健康學(xué)院殷堃研究員,、胡沁沁副研究員和郭曉奎教授為該論文的共同通訊作者,。本研究得到國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(22104090)、上海市自然科學(xué)基金項(xiàng)目(22ZR1436200)和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)國家重大科技基礎(chǔ)設(shè)施(上海)(TMSK-2021-114)的支持,。

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