日前,，生物信息學(xué)領(lǐng)域著名雜志《Nucleic Acids Research》發(fā)表了基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院細(xì)胞分化與凋亡重點實驗室張健研究員課題組的最新研究成果：ASD: a comprehensive database of allosteric proteins and modulators,。
Allosteric regulation（別構(gòu)調(diào)節(jié)），是指利用調(diào)節(jié)物（配體或其它分子）結(jié)合在蛋白質(zhì)活性位點以外的位點（別構(gòu)位點）所產(chǎn)生的一種直接,、快速、有效的蛋白質(zhì)功能、結(jié)構(gòu)或適應(yīng)性的調(diào)節(jié)方式,，參與細(xì)胞代謝，信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等重要生命過程,。
張健課題組采用數(shù)據(jù)挖掘方式,，通過生物信息學(xué)手段分析了存在別構(gòu)效應(yīng)的各種蛋白，揭示了別構(gòu)效應(yīng)發(fā)生的機理和出現(xiàn)的方式,，探討了別構(gòu)損傷和腫瘤,、早老性癡呆等疾病的相關(guān)性，總結(jié)了發(fā)揮別構(gòu)調(diào)節(jié)作用的小分子的本質(zhì)特征,。結(jié)果顯示別構(gòu)效應(yīng)總是伴隨著大規(guī)模蛋白構(gòu)象變化產(chǎn)生,，別構(gòu)位點的殘基變化會一定程度上影響其構(gòu)象變化，從而引起相關(guān)疾病的產(chǎn)生,；同時具有反向調(diào)節(jié)作用的別構(gòu)化學(xué)小分子可以高度特異性的緩解相應(yīng)疾病的發(fā)生與發(fā)展,；該研究的另一個重要創(chuàng)新是首次建立了一系列別構(gòu)分子的識別方法，包括別構(gòu)蛋白的鑒定,、別構(gòu)結(jié)合位點的預(yù)測及別構(gòu)化學(xué)小分子的發(fā)現(xiàn),。該研究受到了論文評閱人的高度好評,，認(rèn)為它不僅為別構(gòu)組學(xué)的發(fā)展提供了堅實的基礎(chǔ)，拓展了別構(gòu)效應(yīng)的生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用范圍,，而且為新的別構(gòu)化學(xué)分子進(jìn)入藥物發(fā)現(xiàn)和開發(fā)流程給與了指導(dǎo)性的策略,。
張健課題組一直致力于綜合利用化學(xué)、信息學(xué)和分子生物學(xué)開展重大疾病靶標(biāo)識別和活性小分子發(fā)現(xiàn)的研究,。論文第一作者黃志敏系張健研究員碩士研究生,。此項成果得到上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)科學(xué)研究院啟動經(jīng)費及新藥國家重點實驗室開放基金的資助。
